Роль интегративных конъюгативных элементов (ICE) в реализации устойчивости Vibrio сholerae к тяжелым металлам



Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Цель работы - заключалась в идентификации возможных генов, обуславливающих резистентность к тяжелыи металлам у токсигенных холерных вибрионов.  В работе использовали два штамма V. cholerae О1 – 83 и  5879  и E. coli QD5003 Rif r. Выборка полных геномов токсигенных холерных вибрионов для анализа in silico была представлена 1880 штаммами различных серогрупп и сроков выделения. При проведении сравнительного биоинформационного анализа путем вычитания геномов в штамме V. cholerae   83 был обнаружен ген, идентифицированный на основании данных  GenBank (последовательность MVB73536.1)  как  czcA. При анализе секвенированных геномов 1880 штаммов V. cholerae различных серогрупп и сроков выделения  czcA был выявлен у 159 токсигеных штаммов  V. cholerae из 1125 исследованных (14,1 %), но не в одном из 775 геномов нетоксигенных вибрионов. Путем проведения ПЦР с виртуальными праймерами in silico ген czcA был идентифицирован у штамма V. cholerae 83  в составе интегративно-коньюгативного элемента типа ICEVchBan11. Среди 159 czcA+ геномов V. cholerae было достоверно идентифицировано два типа интегративно-коньюгативных элементов: 113 ICEVchBan9 и 27 ICEVchBan11.  Для анализа возможной биологической роли czcA был осуществлен коньюгативный перенос   ICEVchBan11 в клетки V. cholerae  5879, при этом   клетки czcA+ штамма 5879 достоверно повысили резистентность к ионам кадмия. Полученные данные могут свидетельствовать о биологической целесообразности присутствия гена czcA у токсигенных холерных вибрионов как фактора повышения устойчивости к токсическому действию тяжелых металлов, в частности кадмия, при возможном попадании в водоемы с повышенным содержанием его ионов.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Сергей Олегович Водопьянов

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека

Автор, ответственный за переписку.
Email: serge100v@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4336-0439
SPIN-код: 4672-9310
Scopus Author ID: 6701686549

доктор медицинских наук, главный научный сотрудник

Россия

Список литературы

  1. Носков А.К., Кругликов В.Д., Москвитина Э.А. и др. Характеристика эпидемиологической ситуации по холере в мире и в Российской Федерации в 2020 г. и прогноз на 2021 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2021;(1):43-51.
  2. Носков А.К., Кругликов В.Д., Москвитина Э.А. и др. Холера: тенденции развития эпидемического процесса в 2021 г., прогноз на 2022 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2022;(1):24-34.
  3. Chen R., Tu H., Chen T. Potential application of living microorganisms in the detoxification of heavy metals . Foods. - 2022. - Т. 11. - №. 13. - С. 1905. doi: 10.3390/foods11131905.
  4. Sandhi A, Yu C, Rahman MM. et al. Arsenic in the water and agricultural crop production system: Bangladesh perspectives. Environ Sci Pollut Res Int. 2022 Jul;29(34):51354-51366. doi: 10.1007/s11356-022-20880-0.
  5. Bueno E, Pinedo V, Shinde DD. et al. Transient Glycolytic Complexation of Arsenate Enhances Resistance in the Enteropathogen Vibrio cholerae. mBio. 2022 Oct 26;13(5):e0165422. doi: 10.1128/mbio.01654-22.
  6. Кленова И. А., Шульга Т. Г. Технология очистки реки Темерник. Инженерный вестник Дона. - 2018. - №. 1 (48). - С. 118.
  7. Fang J, Cheng H, Yu T. et al. Occurrence of Virulence Factors and Antibiotic and Heavy Metal Resistance in Vibrio parahaemolyticus Isolated from Pacific Mackerel at Markets in Zhejiang, China. J Food Prot. 2020 Aug 1;83(8):1411-1419. doi: 10.4315/JFP-20-091.
  8. Yu P, Yang L, Wang J. et al. Genomic and Transcriptomic Analysis Reveal Multiple Strategies for the Cadmium Tolerance in Vibrio parahaemolyticus N10-18 Isolated from Aquatic Animal Ostrea gigas Thunberg. Foods. 2022 Nov 23;11(23):3777. doi: 10.3390/foods11233777.
  9. Kang CH, Shin Y, Yu H. et al. Antibiotic and heavy-metal resistance of Vibrio parahaemolyticus isolated from oysters in Korea. Mar Pollut Bull. 2018 Oct; 135:69-74. doi: 10.1016/j.marpolbul.2018.07.007.
  10. Song Y, Yu P, Li B. et al. The mosaic accessory gene structures of the SXT/R391-like integrative and conjugative elements derived from Vibrio spp. isolated from aquatic products and environment in the Yangtze River Estuary, China. BMC Microbiol. 2013 Sep 30; 13:214. doi: 10.1186/1471-2180-13-214.
  11. Fu H, Yu P, Liang W. et al. Virulence, Resistance, and Genomic Fingerprint Traits of Vibrio cholerae Isolated from 12 Species of Aquatic Products in Shanghai, China. Microb Drug Resist. 2020 Dec;26(12):1526-1539. doi: 10.1089/mdr.2020.0269.
  12. Xu M, Wu J, Chen L. Virulence, antimicrobial and heavy metal tolerance, and genetic diversity of Vibrio cholerae recovered from commonly consumed freshwater fish. Environ Sci Pollut Res Int. 2019 Sep;26(26):27338-27352. doi: 10.1007/s11356-019-05287-8.
  13. Водопьянов С.О., Герасименко А.А., Ежова М.И., Евтеев А.В., Водопьянов А.С., Горох А.М., Олейников И.П., Писанов Р.В., Кругликов В.Д., Квасов А.Р. Сочетанная встречаемость гена холодового шока csh1 и гена устойчивости к мышьяку arsB у Vibrio cholerae O1, O139, nonO1/nonO139 серогрупп. Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А. Овчинникова 2023; 19(3):14-21.
  14. Wick R.R., Judd L.M., Cerdeira L.T. et al. Trycycler: consensus long-read assemblies for bacterial genomes. Genome Biology. 2021;22: 266.doi: https: doi.org/10.1186/s13059-021-02483-z.
  15. Wick R.R., Judd L.M., Holt K.E. Assembling the perfect bacterial genome using Oxford Nanopore and Illumina sequencing. PLoS Comput. Biol. 2023;19(3): e1010905. doi: 10.1371/journal.pcbi.1010905.
  16. Sequence correction provided by ONT research. https: github.com/nanoporetech/medaka. Интернет-ресурс [дата обращения 24.10.2023].
  17. Walker B.J., Abeel T., Shea T. et al. Pilon: an integrated tool for comprehensive microbial variant detection and genome assembly improvement.PLoS One. 2014; 9(11): e112963, doi: 10.1371/journal.pone.0112963
  18. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Писанов Р.В. V. cholerae ICE Genotyper программа для ЭВМ . Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ 2023663855. Заявка 2023663090. Дата поступления 21 06. 2023.Дата государственной регистрации в Реестре программ для ЭВМ 28 июня 2023.
  19. Селянская Н. А., Титова С. В., Меньшикова Е. А., Водопьянов С. О., Кругликов В. Д. Влияние условий культивирования на передачу генов антибиотикорезистентности у холерного вибриона. Антибиотики и химиотер. 2024; 69 (9-10): 4-10. doi: https:. doi.org/10.37489/0235-2990-2024-69-9-10-4-10. EDN: QYNJYC
  20. Nies DH, Nies A, Chu L, Silver S. Expression and nucleotide sequence of a plasmid-determined divalent cation efflux system from Alcaligenes eutrophus. Proc Natl Acad Sci U S A. 1989 Oct;86(19):7351-5. doi: 10.1073/pnas.86.19.7351.
  21. Водопьянов С. О. и др. Распространенность ICE элементов различных типов у V. cholerae . Здоровье населения и среда обитания. - 2018. - №. 1 (298). - С. 33-35.
  22. Nies DH. The cobalt, zinc, and cadmium efflux system CzcABC from Alcaligenes eutrophus functions as a cation-proton antiporter in Escherichia coli. J Bacteriol. 1995 May;177(10):2707-12. doi: 10.1128/jb.177.10.2707-2712.1995.
  23. Kaci A, Petit F, Lesueur P, Boust D, Vrel A, Berthe T. Distinct diversity of the czcA gene in two sedimentary horizons from a contaminated estuarine core. Environ Sci Pollut Res Int. 2014 Sep;21(18):10787-802. doi: 10.1007/s11356-014-3029-y. Epub 2014 Jun 4
  24. Dahanayake PS, Hossain S, Wickramanayake MVKS, Heo GJ. Antibiotic and heavy metal resistance genes in Aeromonas spp. isolated from marketed Manila Clam (Ruditapes philippinarum) in Korea. J Appl Microbiol. 2019 Sep;127(3):941-952. doi: 10.1111/jam.14355. Epub 2019 Jul 7.
  25. Kumarage PM, Majeed S, De Silva LADS, Heo GJ. Detection of virulence, antimicrobial resistance, and heavy metal resistance properties in Vibrio anguillarum isolated from mullet (Mugil cephalus) cultured in Korea. Braz J Microbiol. 2023 Mar;54(1):415-425. doi: 10.1007/s42770-023-00911-9. Epub 2023 Feb 3. PMID: 36735199; PMCID: PMC9944176

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Эко-вектор,



СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ЭЛ № ФС 77 - 80652 от 15.03.2021
. Учредитель ООО "Эко-Вектор Ай-Пи" (ОГРН 1157847215338).