Биочипы в диагностике туберкулеза и микобактериозов



Цитировать

Полный текст

Аннотация

Показано, что использование молекулярных биочипов существенно ускоряет лабораторную диагностику туберкулеза и микобактериозов, а в комплексе с автоматизированной системой BACTEC MGIT 960 позволяет получить результат за 10 дней у 90% обследованных независимо от массивности бацилловыделения. Кроме того, данные метод позволяет изучать генетическое разнообразие типов мутаций и их сочетаний в генах rpoB, katG, inhA, oxyR и gyrA и в короткий срок выявлять лекарственно-устойчивые штаммы микобактерий, а также может служить дополнительными генетическими маркерами для штаммов микобактерий туберкулеза, циркулирующих в Московском регионе.

Об авторах

Виталий Ильич Литвинов

Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

Email: MNPCBTLV@yandex.ru
акад. РАМН, проф., главный фтизиатр ДЗМ, дир. Московского городского научно-практического центра борьбы с туберкулезом ДЗМ; Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

Елена Юрьевна Носова

Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

канд. мед. наук, вед. науч. сотр. отд. проблем лаб. диагностики Московского городского научно-практического центра борьбы с туберкулезом ДЗМ; Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

Александровна Краснова

Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

канд. мед. наук, вед. науч. сотр. отд. проблем лаб. диагностики Московского городского научно-практического центра борьбы с туберкулезом ДЗМ; Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

Ксения Юрьевна Галкина

Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

канд. биол. наук, вед. науч. сотр., отд. проблем лаб. диагностики Московского городского научно-практического центра борьбы с туберкулезом ДЗМ; Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

Анастасия Александровна Букатина

Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

науч. сотр., отд. проблем лаб. диагностики Московского городского научно-практического центра борьбы с туберкулезом ДЗМ; Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

Аркадий Максович Мороз

Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

д-р мед. наук, проф. зав. отд. проблем лаб. диагностики Московского городского научно-практического центра борьбы с туберкулезом ДЗМ; Московский городской научно-практический центр борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения Москвы

V I Litvinov

E Yu Nosova

M A Krasnova

K Yu Galkina

A A Bukatina

A M Moroz

Список литературы

  1. Дорожкова И. Р., Фрейман Г. Е., Абрамова З. П. и др. Новая технология для скрининга туберкулеза легких.// Рос. мед. журн. - 2007. - № 2. - С. 12-15.
  2. Макарова М. В., Краснова М. А., Фрейман Г. Е., Литвинов В. И. Частота обнаружения разных видов нетуберкулезных микобактерий в Москве // Туберкулез и бол. легких. - М. - 2009. - № 9. - С. 29-32.
  3. Мирзабеков А. Д. Биочипы в биологии и медицине XXI века. Вестн. РАН. - 2003. - Т. 73, № 5. - С. 412.
  4. Носова Е. Ю., Галкина К. Ю., Антонова О. В. и др. Молекулярно-биологический микрочип ТБ-БИОЧИП-2 для определения чувствительности Mycobacterium tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью к фторхинолонам у больных с впервые выявленным и хроническим течением туберкулеза // Вестн. РАМН. - 2008. - № 3 - С. 16-19.
  5. Скотникова О. И., Соболев А. Ю., Демкин В. В. и др. Использование метода нестед-ПЦР в диагностике туберкулеза // Бюлл. экспер. биол. и мед. - 2000. - № 6. - С. 717-720.
  6. Скотникова О. И., Галкина К. Ю., Носова Е. Ю. Характеристика чувствительности M. tuberculosis к рифампицину и изониазиду посредством определения мутаций в генах rpoB, katG, inhA, oxyR, kasA различными молекулярно-биологическими методами // Пробл. туб. - 2005. - № 8. - С. 42-45.
  7. Хоменко А. Г., Голышевская В. И., Корнеев М. А. и др. Распространенность и микробиологическая характеристика штаммов M.tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью // В сб.: Туберкулез. - М., 1999. - С. 1-6.
  8. Черноусова Л. Н., Ларионова Е. Е., Севастьянова Э. В. Роль ПЦР-анализа в комплексных бактериологических исследованиях во фтизиатрии // Пробл. туб. - 2001. - № 3. - С. 58-60.
  9. Antonova O. V., Gryadunov D. A, Lapa S. A. et al. Detection of mutations in Mycobacterium tuberculosis genome determining resistance to fluoroquinolones by hybridization on biological microchips// Bull Exp Biol Med.- 2008. - Vol. 145. - P. 108-113.
  10. Blakemore R., Story E., Helb D. et al. Evaluation of the analytical performance of the Xpert MTB/RIF assay // J. Clin. Microbiol. - 2010. - Vol. 48. - P. 2495-2501.
  11. Brossier F., Veziris N., Truffot-Pernot C. et al. Performance of the genotype MTBDR line probe assay for detection of resistance to rifampin and isoniazid in strains of Mycobacterium tuberculosis with low- and high-level resistance // J Clin Microbiol. - 2006. - Vol. 44. - P. 3659-3664.
  12. Brossier F., Veziris N., Aubry A. et al. Detection by GenoType MTBDRsl test of complex mechanisms of resistance to second-line drugs and ethambutol in multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis complex isolates // J. Clin. Microbiol. - 2010. - Vol. 48. - P. 1683-1689.
  13. C. Updated Guidelines for the Use of Nucleic Acid Amplification Tests in the Diagnosis of Tuberculosis. MMWR: CDC. - 2000. - P. 7-10.
  14. Chakrabarti P. Drug targets and drug resistance in mycobacteria. // Proc. Natl Acad. Sci. India, B. - 1997. - Vol. 67. - P. 169-179.
  15. Chang H., Heo S., Yoo K. et al. Detection of mycobacterium tuberculosis complex using real-time polymerase chain reaction // Korean J. Lab. Med. - 2008. - Vol. 28. - P. 103-108.
  16. Gryadunov D., Mikhailovich V., Lapa S. et al. Evaluation of hybridisation on oligonucleotide microarrays for analysis of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis // Clin. Microbiol. Infect. - 2005. - Vol. 11. - P. 531-539.
  17. Heifets L. Mycobacterial infections caused by nontuberculous mycobacteria // Am. J. Respir. Crit. Care Med. - 2004. - Vol. 25. - P. 283-295.
  18. Lee H., Bang H-E., Bai G-H. et al. Novel polymorphic region of the rpoB gene containing Mycobacterium species-specific sequences and its use in identification of mycobacteria // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41. - P. 2213-2218.
  19. Migliori G., Richardson M. Multidrug-resistant and Extensively Drug- resistant tuberculosis in the West. Europe and United States:Epidemiology, surveillance, and control // Clin. Chest. Med. - 2009. - Vol. 30. - P. 637-665.
  20. Mikhailovich V., Gryadunov D., Kolchinsky A. et al. DNA microarrays in the clinic: infectious diseases // Bioessays. - 2008. - Vol. 30. - P. 673-682.
  21. Mokrousov I., Narvskaya O., Otten T. High prevalence of katG Ser315Thr substitution among isoniazid resistant M.tuberculosis clinical isolates from Northwestern Russia,1996 to 2001 // Antimicrob. Agents Chemother. - 2002. - Vol. 46. - P. 1417- 1424.
  22. Musser J. Antimicrobial agent resistance in mycobacteria: molecular genetic insights // Clin. Microbiol. Rev. - 1995. - Vol. 8. - P. 496-514.
  23. Nyendak M. R., Lewinsohn D. A., Lewinsohn D. M. New diagnostic methods for tuberculosis // Curr. Opin. Infect Dis. - 2009. - Vol. 22. - P. 174-182.
  24. Pai M., Minion J., Sohn H. et al. Novel and improved technologies for tuberculosis diagnosis: progress and challenges // Clin Chest Med. - 2009. - Vol. 30. - P. 701-716.
  25. Safianowska A., Walkiewicz R., Nejman-Gryz P. et al. The comparison between two methods for typing of nontuberculous mycobacteria: high pressure liquid chromatography and molecular assay GenoType Mycobacterium CM/AS // Pneumonol. Alergol. Pol. - 2010. - Vol. 78. - P. 363-368.
  26. Shinnick T., Jonas V. Molecular approaches to the diagnosis of tuberculosis // Tuberculosis: Pathogenesis, Protection and Control. - Washington. D. C., 1994. - Ch. 30. - P. 517-527.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО "Эко-вектор", 2011


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ЭЛ № ФС 77 - 80652 от 15.03.2021 . Учредитель ООО "Эко-Вектор Ай-Пи" (ОГРН 1157847215338).