Экспресс-метод определения чувствительности возбудителей бактериальных осложнений к бактериофагам при COVID-19
- Авторы: Краева Л.А.1, Конькова Л.С.1, Бургасова О.А.2, Долинный С.В.2,3
-
Учреждения:
- Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
- Российский университет дружбы народов
- Городская клиническая больница имени В.П. Демихова
- Выпуск: Том 28, № 1 (2023)
- Страницы: 15-22
- Раздел: Оригинальные исследования
- Статья получена: 02.02.2023
- Статья одобрена: 27.02.2023
- Статья опубликована: 22.03.2023
- URL: https://rjeid.com/1560-9529/article/view/181621
- DOI: https://doi.org/10.17816/EID181621
- ID: 181621
Цитировать
Полный текст



Аннотация
Обоснование. В последние годы наблюдается катастрофический рост резистентности штаммов бактерий к антибактериальным препаратам. Распространение пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19 привело к чрезмерному упредительному использованию антибиотиков, что вызвало ещё более широкое распространение резистентных штаммов в стационарах. Учитывая накопленный положительный опыт использования бактериофагов, целесообразно их применение у пациентов после определения чувствительности каждого штамма выделенных бактерий к бактериофагам. Учитывая, что чаще всего при осложнённых формах COVID-19 выделялись бактерии Klebsiella pneumoniae, возникла необходимость в быстром определении чувствительности этих и других грамотрицательных бактерий к соответствующим бактериофагам.
Цель исследования ― сокращение сроков определения чувствительности выделенной культуры микроорганизма к бактериофагам путём разработки экспресс-метода.
Материалы и методы. Объектами исследования служили 30 штаммов панрезистентных грамотрицательных микроорганизмов из коллекции музея лаборатории медицинской бактериологии НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера в Санкт-Петербурге: Klebsiella pneumoniae (n=10), Escherichia сoli (n=10), Pseudomonas aeruginosa (n=10), а также препараты бактериофагов производства АО «НПО “Микроген”»: Бактериофаг клебсиелл поливалентный очищенный; Бактериофаг колипротейный; Бактериофаг псевдомонас аеругиноза (синегнойный).
Результаты. Чувствительными к поливалентным препаратам бактериофагов оказались 4 из 10 исследуемых штаммов K. pneumoniae, 6 из 10 штаммов E. coli и 7 из 10 штаммов P. aeruginosa. Достоверные результаты были получены через 3 часа от момента постановки чувствительности выделенных культур к бактериофагам, что, несомненно, является важнейшей находкой проведённого исследования.
Заключение. Разработанный способ определения чувствительности грамотрицательных бактерий к бактериофагам позволяет сократить время исследования в 6 раз (до 3 часов), что сказывается на сроках подбора этиотропной терапии бактериофагами для каждого пациента.
Полный текст

Об авторах
Людмила Александровна Краева
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Email: lykraeva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9115-3250
SPIN-код: 4863-4001
д-р мед. наук, профессор
Россия, 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14Лидия Сергеевна Конькова
Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Email: lidia.kireeva@yandex.ru
ORCID iD: 0009-0007-5400-3513
SPIN-код: 3527-7121
Россия, 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14
Ольга Александровна Бургасова
Российский университет дружбы народов
Email: olgaburgasova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5486-0837
SPIN-код: 5103-0451
д-р мед. наук, профессор
Россия, МоскваСергей Владимирович Долинный
Российский университет дружбы народов; Городская клиническая больница имени В.П. Демихова
Автор, ответственный за переписку.
Email: sdolinny.ru@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-0690-2174
SPIN-код: 7832-4832
MD
Россия, Москва; МоскваСписок литературы
- Antimicrobial Resistance Collaborators. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: A systematic analysis // Lancet. 2022. Vol. 399, N 10325. P. 629–655. doi: 10.1016/S0140-6736(21)02724-0
- Blair J.M., Webber M.A., Baylay A.J., et al. Molecular mechanisms of antibiotic resistance // Nat Rev Microbiol. 2015. Vol. 13, N 1. Р. 42–51. doi: 10.1038/nrmicro3380
- Никифоров В.В., Суранова Т.Г., Миронов А.Ю., и др. Новая коронавирусная инфекция (COVID-19): этиология, эпидемиология, клиника, диагностика, лечение и профилактика. Учебное пособие. Москва, 2020. 48 с.
- Hill C., Mills S., Ross R.P. Phages & antibiotic resistance: Are the most abundant entities on earth ready for a comeback? // Future Microbiol. 2018. Vol. 13. P. 711–726. doi: 10.2217/fmb-2017-0261
- Брусина Е.Б., Дроздова О.М., Алешкин А.В. Проблемы комплексного применения бактериофагов для профилактики и лечения // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2018. № 3. С. 11–15. doi: 10.18565/epidem.2018.3.11-5
- Golkar Z., Bagasra O., Pace D.G. Bacteriophage therapy: A potential solution for the antibiotic resistance crisis // J Infect Dev Ctries. 2014. Vol. 8, N 2. P. 129–136. doi: 10.3855/jidc.3573
- Патент РФ на изобретение RU 2 785 461 C1. Краева Л.А., Конькова Л.С. Экспресс-метод определения чувствительности грамотрицательных бактерий к бактериофагам. Режим доступа: https://patenton.ru/patent/RU2785461C1. Дата обращения: 15.12.2022.
- Segall A.M., Roach D.R., Strathdee S.A. Stronger together? Perspectives on phage-antibiotic synergy in clinical applications of phage therapy // Curr Opin Microbiol. 2019. Vol. 51. P. 46–50. doi: 10.1016/j.mib.2019.03.005
- Chan B.K., Turner P.E., Kim S., et al. Phage treatment of an aortic graft infected with Pseudomonas aeruginosa // Evol Med Public Health. 2018. Vol. 2018, N 1. P. 60–66. doi: 10.1093/emph/eoy005
- Castillo D., Rørbo N., Jørgensen J., et al. Phage defense mechanisms and their genomic and phenotypic implications in the fish pathogen Vibrio anguillarum // FEMS Microbiol Ecol. 2019. Vol. 95, N 3. doi: 10.1093/femsec/fiz004
- Reyes-Robles T., Dillard R.S., Cairns L.S., et al. Vibrio cholerae outer membrane vesicles inhibit bacteriophage infection // J Bacteriol. 2018. Vol. 200, N 15. P. e00792-17. doi: 10.1128/JB.00792-17
- Montso P.K., Mlambo V., Ateba C.N. Efficacy of novel phages for control of multi-drug resistant Escherichia coli O177 on artificially contaminated beef and their potential to disrupt biofilm formation // Food Microbiol. 2021. Vol. 94. P. 103647. doi: 10.1016/j.fm.2020.103647
- Harper D.R. Criteria for selecting suitable infectious diseases for phage therapy // Viruses. 2018. Vol. 10, N 4. P. 177. doi: 10.3390/v10040177
- Kunz Coyne A.J., Stamper K., Kebriaei R., et al. Phage cocktails with daptomycin and ampicillin eradicates biofilm-embedded multidrug-resistant Enterococcus faecium with preserved phage susceptibility // Antibiotics (Basel). 2022. Vol. 11, N 9. P. 1175. doi: 10.3390/antibiotics11091175
Дополнительные файлы
