


Том 89, № 5 (2024)
Статьи
CAR за пределами классических CAR-T: особенности функционирования и перспективы использования (обзор)
Аннотация
Химерный антигенный рецептор (CAR) представляет собой генно-инженерный рецептор, распознающий антиген и вследствие этого запускающий сигнальный каскад в клетке. В распознавании и проведении сигнала участвуют домены CAR, происходящие от разных белков, поэтому CAR имеют смешанный доменный состав. T-Клетки, несущие CAR к опухолеассоциированным антигенам, легли в основу CAR-T-терапии – нового подхода к терапии злокачественных новообразований. Несмотря на то что CAR-T-терапия показала высокую эффективность в лечении онкогематологических заболеваний, этот подход имеет ряд недостатков, которые, потенциально, могут быть устранены при использовании в качестве эффекторных клеток других типов лейкоцитов. На данный момент экспрессия CAR, приводящая к появлению или усилению цитотоксических свойств, показана для широкого спектра клеток как адаптивного, так и врожденного иммунитета. В этом обзоре будут рассмотрены особенности функционирования CAR в разных типах клеток иммунной системы. Особое внимание будет уделено результатам доклинических и клинических исследований эффективности и безопасности потенциальных CAR-клеточных продуктов.



Пептидные блокаторы индуцированных взаимодействий сигнальных белков: текущее состояние и перспективы развития (обзор)
Аннотация
Образование транзиторных белковых комплексов в ответ на активацию клеточных рецепторов является общим механизмом ответа клетки на внешние стимулы. В настоящем обзоре представлена концепция блокировки взаимодействий сигнальных белков пептидными блокаторами, а также описаны имеющиеся к настоящему времени достижения в разработке ингибиторов передачи сигнала, блокирующих сигнал-зависимые белковые взаимодействия.



Нарушения толерантности иммунной системы в отношении аутологичных ИПСК и их дифференцированных производных (обзор)
Аннотация
Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК) благодаря своей способности к дифференцировке в любой тип соматических клеток являются многообещающим инструментом для решения проблем трансплантационной медицины. Более того, технология репрограммирования делает возможным получение персонализированного, то есть пациент-специфического, клеточного продукта, при трансплантации которого не должны возникать проблемы, связанные с гистосовместимостью пересаженных тканей и органов. В то же время противоречивые сведения о главном преимуществе производных ИПСК аутологичного происхождения − отсутствию иммуногенности − все же ставят под сомнение применение таких клеток вне протоколов иммуносупрессивной терапии. Этот обзор посвящен иммуногенным свойствам сингенных и аутологичных ИПСК и их производных, а также рассмотрению возможных причин нарушения их иммунологической толерантности.



Взаимосвязь метаболических изменений и функций макрофагов в гомеостазе и при воспалении (обзор)
Аннотация
В последнее время особое внимание уделяют изучению связи иммунологических процессов с изменениями клеточного обмена веществ. Это взаимодействие лежит в основе, с одной стороны, поддержания гомеостаза и целостности тканей, с другой – воспаления как неотъемлемой части иммунного ответа. Метаболические адаптации не только обеспечивают иммунные реакции энергией, но и влияют на функции иммунных клеток путем контроля транскрипционных и посттранскрипционных программ. В связи с этим изучение метаболизма иммунных клеток способствует поиску новых подходов к лечению целого ряда заболеваний, в том числе связанных с метаболическими нарушениями. Ключевую роль в поддержании гомеостаза и регуляции воспаления играют макрофаги – клетки врожденной иммунной системы, характеризующиеся высокой функциональной пластичностью. В зависимости от фенотипа и происхождения они могут как выполнять регуляторные функции, так и способствовать развитию воспаления и усугублять течение заболевания. Поэтому то, как именно происходит адаптация миелоидных клеток в ответ на воздействие факторов микроокружения, может определять силу и характер реакции организма в целом. В обзоре рассмотрено влияние метаболических изменений в макрофагах на их функциональные свойства, в том числе поляризацию. В контексте воспалительных и метаболических заболеваний особое внимание уделено роли иммунометаболических адаптаций миелоидных клеток в поддержании гомеостаза тканей и протекании различных патологических процессов. В заключительной части обзора рассмотрены способы модуляции метаболизма макрофагов в качестве потенциального терапевтического подхода.



Сенесцентные макрофаги, ассоциированные с опухолью, их маркеры и роль в микроокружении опухоли (обзор)
Аннотация
Ассоциированные с опухолью макрофаги (ТАМ) представляют собой важный компонент микроокружения опухоли и наиболее распространенную популяцию иммунных клеток, инфильтрирующих опухоль. В значительной мере именно ТАМ могут определять направленность противоопухолевого иммунного ответа, усиливая его или, наоборот, способствуя формированию иммуносупрессивного микроокружения, позволяющего опухоли избегать контроля со стороны иммунной системы. Вследствие взаимодействия с опухолевыми клетками или другими клетками микроокружения, а также в результате действия противоопухолевых лекарственных средств у макрофагов может развиваться состояние сенесцентности. В данном обзоре мы попытались обобщить сведения, имеющиеся в литературе, о роли сенесцентных макрофагов в опухоли. В связи с разработкой в последнее время стратегий сенолитической терапии, направленной на удаление сенесцентных клеток из организма, представляется важным обсуждение функций сенесцентных макрофагов и потенциала использования сенолитических препаратов с точки зрения репрограммирования ТАМ для усиления противоопухолевого иммунного ответа и повышения эффективности лечения онкологических заболеваний.



Обратная генетика в приложении к иммунобиологии фактора некроза опухолей – многофункционального цитокина (мини-обзор)
Аннотация
Фактор некроза опухолей (TNF) – один из многих цитокинов, белковых молекул, осуществляющих коммуникацию между клетками иммунной системы. TNF был открыт и получил свое громкое название благодаря яркому противоопухолевому эффекту в конкретной экспериментальной системе, однако оказалось, что его главные физиологические функции в контексте целого организма вовсе не связаны с защитой от опухолей. В этом небольшом обзоре обсуждаются результаты, полученные с помощью «рукотворных» мышиных моделей, созданных с помощью ранних технологий редактирования генома и позволивших установить истинные функции TNF в норме и при некоторых патологиях, а также перспективы совершенствования терапии TNF-зависимых заболеваний, которые открываются на основе этих знаний.



Антигенное картирование SARS-CoV-2 (обзор)
Аннотация
Антигенная картография – это подход, позволяющий визуализировать антигенные различия вариантов вируса на основании титров вирус-нейтрализации сывороток. Этот подход с успехом используется при выборе штамма вакцины вируса гриппа. С появлением вариантов SARS-CoV-2, ускользающих от вакцино-индуцированного антительного ответа, возникла необходимость изменения и вакцин против COVID-19. В данном обзоре представлена информация об антигенных различиях вариантов SARS-CoV-2, полученная методом антигенной картографии. Кроме того, описаны возможности методов, основанных на антигенном картировании, а именно: построение антительных ландшафтов и графиков увеличения широты нейтрализации для количественной оценки широты антительного ответа. Понимание антигенных различий вариантов SARS-CoV-2 и возможностей сформированного гуморального иммунитета способствует своевременному обновлению профилактических вакцин против COVID-19.



Особенности гуморального и клеточного иммунного ответа на S- и N-белки вируса SARS-CoV-2
Аннотация
Пандемия новой коронавирусной инфекции, продолжавшаяся более 3 лет, до сих пор сопровождается частыми мутациями в S-белке вируса SARS-CoV-2 и появлением всё новых вариантов вируса, вызывающих очередные вспышки заболеваемости. Из всех белков коронавирусов наиболее иммуногенными являются S- и N-белки. Целью настоящего исследования было сопоставление особенностей гуморальных и Т-клеточных иммунных ответов на S- и N-белок вируса SARS-CoV-2 у людей с разной историей взаимодействия с этим вирусом. Были обследованы: 27 человек, перенёсших COVID-19; 23 дважды привитых вакциной «Спутник V» и не болевших COVID-19; 22 человека, перенёсших COVID-19 и через 6–12 мес. дважды привитых вакциной «Спутник V», и 25 человек, дважды переболевших COVID-19. Уровень антител определяли иммуноферментным методом, клеточный иммунитет определяли по экспрессии CD107a на CD8high лимфоцитах после распознавания ими антигенов вируса SARS-CoV-2. Показано, что гуморальный иммунный ответ на N-белок формируют преимущественно короткоживущие плазмоциты, синтезирующие IgG-антитела всех четырёх субклассов с постепенным переключением с IgG3 на IgG1. Ответ на S-белок представлен как короткоживущими плазмоцитами, формирующимися в начале ответа (IgG1- и IgG3-субклассы), так и долгоживущими (IgG1-субкласс). Динамика уровня антител, синтезируемых короткоживущими плазмоцитами, описывается распределением Фишера, а для описания уровня антител, синтезируемых долгоживущими плазмоцитами, более подходит распределение Эрланга. Уровень антител в группах с гибридным иммунитетом превышает таковой в группе с поствакцинальным иммунитетом, а в группе с прорывным иммунитетом – превышает уровень как для постинфекционного, так и поствакцинального иммунитета. Клеточный иммунитет на S- и N-белки вируса SARS-CoV-2 несколько различается в зависимости от способов его индукции (прививка или заболевание). Важно, что гетерологичные иммунные ответы CD8+ Т-клеток, сформированные на N-белок других коронавирусов, могут участвовать в иммунной защите от SARS-CoV-2.



Микроглия и дендритные клетки как источник IL-6 в мышиной модели рассеянного склероза
Аннотация
Рассеянный склероз (РС) – это комплексное аутоиммунное заболевание центральной нервной системы (ЦНС), приводящее к разрушению миелиновой оболочки нейронов и нарушению проводимости нервных сигналов. Изучение молекулярных механизмов развития РС критически важно, так как заболевание характеризуется ранней манифестацией, хроническим течением и терапией, основанной на симптоматическом лечении. Известно, что цитокины играют ключевую роль в патогенезе РС, при этом одним из ключевых медиаторов является интерлейкин-6 (IL-6). В настоящей работе была исследована роль IL-6, продуцируемого микроглией и дендритными клетками, в развитии экспериментального аутоиммунного энцефаломиелита (ЕАЕ), широко используемой модели РС на мышах. Работу проводили на мышах с клеточно-специфичным удалением IL-6 из CX3CR1+-клеток, в том числе из микроглии, и из дендритных клеток CD11c+. Было установлено, что мыши с удалением IL-6 из микроглии или из дендритных клеток развивают более слабые симптомы по сравнению с мышами дикого типа. В ЦНС мышей с инактивацией IL-6 в микроглии на пике ЕАЕ происходило повышение доли регуляторных Т-клеток (Treg) и снижение процентного содержания патогенетических IFNγ-продуцирующих CD4+ Т-клеток, что коррелировало с уменьшением количества провоспалительных моноцитов. В то же время при удалении IL-6 из микроглии наблюдалось увеличение содержания CCR6+ Т-клеток и GM-CSF-продуцирующих Т-клеток. У мышей с дефицитом IL-6 в дендритных клетках наблюдалось не только ранее описанное увеличение доли Treg и уменьшение доли Т-хелперов, продуцирующих IL-17A (TH17-клеток), но и уменьшение продукции GM-CSF и IFNγ во вторичных лимфоидных органах. Таким образом, функции IL-6 в организме зависят от источника и локализации иммунного ответа: IL-6 из микроглии выполняет как патогенетические, так и протективные функции именно в ЦНС, в то время как IL-6 из дендритных клеток, помимо критически важного участия в соотношении Treg и TH17-клеток, может стимулировать продукцию цитокинов, ассоциированных с патогенетическими функциями Т-клеток.



Молекулярные изменения иммунологических характеристик мультипотентных мезенхимных стромальных клеток костного мозга при лимфоидной неоплазии
Аннотация
Нормальное кроветворение регулируется стромальным микроокружением костного мозга, в состав которого входят разнообразные клетки стромы и лимфоциты. При лимфоидных неоплазиях нарушаются развитие и функционирование клеток иммунной системы, влияющие на строму костного мозга. Мультипотентные мезенхимные стромальные клетки (МСК) участвуют в регуляции иммунного ответа как за счет межклеточного взаимодействия, так и за счет секреции различных цитокинов. При онкогематологических заболеваниях изменяется стромальное микроокружение костного мозга, в том числе и МСК. Целью исследования было описать изменения, происходящие с иммунологической функцией МСК при лимфоидной неоплазии из ранних клеток-предшественниц, локализованных в костном мозге (острый лимфобластный лейкоз, ОЛЛ), и более поздних, расположенных вне костного мозга (диффузная В-клеточная крупноклеточная лимфома, ДВККЛ). Исследовали параметры роста, экспрессию мембранных маркеров, экспрессию генов интереса и секретом МСК от больных ОЛЛ и ДВККЛ до начала лечения и в ремиссии заболевания. В качестве контроля использовали МСК здоровых доноров соответствующих возрастов. Показано, что концентрация МСК в костном мозге больных ОЛЛ снижена до начала лечения и восстанавливается по достижении ремиссии; у больных ДВККЛ этот параметр не изменен. Способность МСК к пролиферации не была изменена у больных ОЛЛ, а в клетках у больных ДВККЛ достоверно повышена, по сравнению с донорами, и до начала лечения, и по достижению ремиссии заболевания. У пациентов иммунофенотип МСК и экспрессия генов, важных для дифференцировки, поддержания иммунологического статуса и секреции цитокинов, достоверно отличались по многим параметрам от таковых у здоровых доноров и зависели от заболевания. Белки, секретируемые МСК, сильно различались у доноров и пациентов. МСК пациентов секретировали меньше белков, связанных с регуляцией иммунного ответа, дифференцировкой и поддержанием стволовых кроветворных клеток. Лимфоидная неоплазия приводит к значительным изменениям в функциональном иммунологическом статусе МСК.



Ассоциированный с фосфатазой CD45 лимфоцитарный фосфопротеин LPAP регулирует её стабильность
Аннотация
Ассоциированный с фосфатазой лимфоцитарный фосфопротеин (LPAP) является белком-партнёром фосфатазы CD45, однако его функция до сих пор мало изучена. Образование прочного комплекса между LPAP и CD45 позволяет предположить, что LPAP способен регулировать CD45, однако прямых биохимических подтверждений этому до сих пор не получено. Мы обнаружили, что на лимфоидных клетках Jurkat уровни белков LPAP и CD45 взаимосвязаны и коррелируют между собой. Нокаут LPAP приводит к снижению, а повышение его уровня, напротив, вызывает увеличение количества поверхностного CD45. На нелимфоидных клетках K562 такой корреляции не обнаруживалось. Мы предполагаем, что LPAP регулирует стабильность фосфатазы CD45, что, в свою очередь, способно влиять на процессы активации лимфоцитов.



Количественный анализ фагоцитоза в цельной крови с применением двойного окрашивания и визуализации
Аннотация
Фагоцитоз – важнейшая функция врождённого иммунитета человека и животных. Снижение способности к фагоцитозу связано со многими заболеваниями и старением иммунной системы. Определение фагоцитарной динамики клеток требует количественной оценки бактерий внутри и снаружи фагоцита. Хотя проточная цитометрия является наиболее распространённым методом оценки фагоцитоза, её использование не предполагает визуализации и прямой количественной оценки пространственной локализации бактерий. В данном исследовании применяли методы проточной цитометрии (сортировки) и конфокальной микроскопии в сочетании с «двухцветной» маркировкой бактерий Escherichia coli, которые использовали как объект фагоцитоза. Для обеспечения высокой производительности количественного и пространственного распознавания двухцветных E. coli, ассоциированных с фагоцитами, также применяли проточную цитометрию с визуализацией в потоке. На основании полученных данных было сделано предположение о важной роли удержания патогенов на поверхности миелоидных и лимфоидных клеток без последующей интернализации. Разработанный метод бактериальной конъюгации существенно повысил точность количественной и пространственной оценки фагоцитоза и может быть рекомендован в качестве вспомогательного подхода при использовании проточных цитометров с визуализацией для анализа фагоцитоза в цельной крови.



Удлинение линкерных последовательностей между антиген-узнающими модулями обеспечивает более эффективную наработку биспецифичных наноантител в периплазме E. coli
Аннотация
Использование технологии получения однодоменных антител (молекул NANOBODY®, также обозначаемых как наноантитела, нАТ, или молекул на основе других стабильных белковых структур) и их производных для решения актуальных задач биомедицины становится всё более популярным. Действительно, формат одного небольшого хорошо растворимого белка со стабильной структурой, полнофункционального в плане специфического узнавания, очень удобен как модуль для создания мультивалентных, би-/олигоспецифичных таргетных генно-инженерных молекул и структур. Наработка нАТ в периплазме бактерии E. coli является очень удобным и достаточно универсальным способом получения аналитических количеств нАТ для первичного изучения свойств этих молекул и выбора наиболее перспективных вариантов. Сложнее пока обстоит дело с наработкой в таких же условиях би- и мультивалентных производных первично отбираемых нАТ. В данной работе разработаны и применены удлинённые линкерные последовательности (52 и 86 а.о.) между антиген-узнающими модулями в клонируемых экспрессионных конструкциях с целью повышения эффективности наработки биспецифичных наноантител (бсНТ) в периплазме бактерий E. coli. Три варианта модельных бсНТ, описанные в этом исследовании, были наработаны в периплазме бактерий и выделены в растворимом виде с сохранением функциональности всех белковых доменов. Если ранее наши попытки наработать в периплазме бсНТ с традиционными линкерами длиной не более 30 а.о. были безуспешными, то применённые здесь удлинённые линкеры обеспечили существенно более эффективную наработку бсНТ, сравнимую по эффективности с традиционной наработкой исходных мономерных нАТ. Использование сильно удлинённых линкеров, предположительно, может быть полезным для повышения эффективности наработки также и других бсНТ, и подобных им молекул в периплазме бактерий E. coli.



Оценка антифибротических свойств вертепорфина в составе коллагенового носителя in vitro и in vivo
Аннотация
При обширных повреждениях кожи возникает необходимость в специализированной терапии, стимулирующей процессы регенерации, но предотвращающей формирование рубцовой ткани. Мы исследовали in vivo и in vitro возможность комбинирования коллагенового геля в качестве агента, закрывающего раневое ложе и привлекающего фибробласты в область повреждения, и вертепорфина (ВП) как антифибротического препарата. In vitro на фибробластах, изолированных из рубцовой ткани человека, проводили оценку влияния ВП на жизнеспособность и экспрессию маркеров миофибробластов. In vivo коллагеновый гель и ВП отдельно и совместно вносили в рану и характеризовали признаки рубцевания при регенерации кожи: отклонения в толщине слоев кожи, интенсивность синтеза коллагена и морфометрические характеристики сформированных волокон внеклеточного матрикса. Результаты показали, что ВП корректирует фибротический фенотип путем подавления экспрессии сократительного белка Sm22α и не вызывает клеточную гибель. Однако при внесении ВП в рану в составе коллагенового геля он теряет способность направлять ранозаживление по бесшрамному типу, что может быть связано с несовместимостью механизмов, за счет которых коллаген и ВП влияют на регенерацию.



Регулярные статьи
Рациональная разработка лекарств, направленных на рецепторы, сопряженные с G-белкoм: поиск и скрининг лигандов (обзор)
Аннотация
Рецепторы, сопряженные с G-белком (G protein-coupled Receptors, GPCR) – трансмембранные белки, участвующие в большинстве физиологических процессов и являющиеся ключевыми фармакологическими мишенями. Недавние успехи структурной биологии GPCR сделали возможной разработку лекарств на основе структуры (Structure-Based Drug Design, SBDD). SBDD использует информацию о комплексе рецептор–лиганд для поиска подходящих соединений, что позволяет расширить химическое пространство поиска без необходимости проведения экспериментального скрининга. В обзор мы включили описание виртуального скрининга лигандов, основанного на структуре мишени и описание методов функционального тестирования потенциальных лекарственных соединений. Мы также обсуждаем последние достижения в развитии подходов SBDD, применимые к GPCR, и выделяем успешные примеры их использования.


