Сравнительная оценка особенностей генетического разнообразия тюленей замкнутых водоемов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Впервые проведена сравнительная оценка генетического разнообразия по нейтральным маркерам (15 микросателлитных локусов ядерной ДНК) двух видов тюленей замкнутых водоемов: байкальской (Pusa sibirica) и каспийской (P. caspica) нерп в сравнении с океаническим видом рода – кольчатой нерпой (P. hispida). Показано, что оба вида, населяющие замкнутые водоемы, характеризуются сниженным уровнем генетического разнообразия, наименьшим у байкальской нерпы. Как для байкальской, так и для каспийской нерпы показана высокая вероятность прохождения через бутылочное горлышко, в то время как для исследованной популяции кольчатой нерпы признаков резкого снижения численности в прошлом выявлено не было. Анализ полученных данных в пакете VarEff позволяет предположить разное время существования последнего общего предка для каждой из трех исследованных популяций; для байкальской нерпы это время оказывается существенно меньшим, чем для каспийской.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

С. И. Мещерский

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: sergeymeshcherskiy@gmail.com
Россия, Москва

И. Г. Мещерский

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Email: sergeymeshcherskiy@gmail.com
Россия, Москва

М. А. Соловьёва

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Email: sergeymeshcherskiy@gmail.com
Россия, Москва

Н. В. Крюкова

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Email: sergeymeshcherskiy@gmail.com
Россия, Москва

М.-Р. Д. Магомедов

Прикаспийский институт биологических ресурсов Дагестанского ФИЦ Российской академии наук

Email: sergeymeshcherskiy@gmail.com

член-корреспондент РАН

Россия, Махачкала

Ф. В. Климов

Казахстанское агентство прикладной экологии (ТОО “КАПЭ”)

Email: sergeymeshcherskiy@gmail.com
Казахстан, Алма-Ата

В. В. Рожнов

Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук

Email: rozhnov-v-2015@yandex.ru

академик РАН

Россия, Москва

Список литературы

  1. Пастухов В.Д. Нерпа Байкала. Новосибирск: Наука. 1993. 272 с.
  2. Петров Е.А. Байкальская нерпа. Улан-Удэ: Экос. 2009. 176 с.
  3. Современное состояние биопродуктивности Каспийского моря и причины деградации популяции тюленя за последние 300 лет. Ред.: Сокольский А.Ф., Абдурахманов Г.М., Попова Н.В. и др. Астрахань: Полиграфком. 2008. 178 с.
  4. Sasaki H., Numachi K., Grachev A. The Origin and Genetic Relationships of the Baikal Seal, Phoca sibirica, by Restriction Analysis of Mitochondrial DNA // Zool. Sci. 2003. V. 20. P. 1417–1422.
  5. Goodman S.J., Clarke L., Jackson A., et al. Assessment of genetic variation, population structure and demographic history of Caspian seals (Pusa caspica) using microsatellites and mitochondrial sequence variation // Marine Mammals of the Holarctic. Collection of scientific papers after the 9th International Conference. Astrakhan, Russia. 31 October – 05 November, 2016. М.: Совет по морским млекопитающим. 2018. V. 1. P. 150–152. https://marmam.ru/upload/conf-documents/mmc2016_full.pdf
  6. Yakupova A., Tomarovsky A., Totikov A., et al. Chromosome-Length Assembly of the Baikal Seal (Pusa sibirica) Genome Reveals a Historically Large Population Prior to Isolation in Lake Baikal // Genes. 2023. 14: 619.
  7. Мещерский С.И., Мещерский И.Г., Соловьёва М.А., Рожнов В.В. Генетические особенности популяции байкальской нерпы (Pusa sibirica) // Доклады российской академии наук. Науки о жизни. 2023. Т. 511. № 1. С. 340–343.
  8. Palo J.U., Mäkinen H.S., Helle E., et al. Microsatellite variation in ringed seals (Phoca hispida): genetic structure and history of the Baltic Sea population // Heredity. 2001. V. 86. P. 609–617.
  9. Repenning C.A., Ray C.E., Gricorescu D. Pinniped biogeography // Gray J., Boucot A.J. (eds). Historical biogeography, plate tectonics, and the changing environment. OR, Corvallis: Oregon State Univ. Press. 1979. P. 357–369.
  10. Palo J.U., Väinölä R. The enigma of the landlocked Baikal and Caspian seals addressed through phylogeny of Phocine mitochondrial sequences // Biol. J. Linnean Society. 2006. V. 88. P. 61–72.
  11. Петров Е.А. Байкальская нерпа: эколого-эволюционные аспекты. Дис. докт. биол. наук. 03.00.16 – экология. Улан-Удэ, БГУ. 2003. 364 c.
  12. Fulton T.L., Strobeck C. Multiple markers and multiple individuals refine true seal phylogeny and bring molecules and morphology back in line // Proc. R. Soc. B. 2010. V. 277, P. 1065–1070.
  13. Nyakatura K., Bininda-Emonds O.R.P. Updating the evolutionary history of Carnivora (Mammalia): a new species-level supertree complete with divergence time estimates // BMC Biology. 2012. V. 10(1): 12.
  14. Davis C.S., Stirling I., Strobeck C., et al. Population structure of ice-breeding seals // Molecular Ecology. 2008. V.17. P. 3078–3094.
  15. Martinez-Bakker M.E., Sell S.K, Swanson B.J., et al. Combined Genetic and Telemetry Data Reveal High Rates of Gene Flow, Migration, and Long-Distance Dispersal Potential in Arctic Ringed Seals (Pusa hispida) // PLoS ONE. 2013. V. 8(10): e77125.
  16. Lang A.R., Boveng P., Quakenbush L., et al. Re-examination of population structure in Arctic ringed seals using DArTseq genotyping // Endangered species research. 2021. V. 44. P. 11–31.
  17. Löytynoja A., Rastas P., Valtonen, et al. Fragmented habitat compensates for the adverse effects of genetic bottleneck // Current Biology. 2023.V. 33. P. 1009–1018.
  18. Rosing-Asvid A., Löytynoja A., Momigliano P., et al. An evolutionarily distinct ringed seal in the Ilulissat Icefjord // Molecular Ecology. 2023. V. 32. P. 5932–5943.
  19. Крылов В.И. Особенности биологии каспийских тюленей южного Каспия // Морские млекопитающие. Тез. докл. IX Всес. совещ. по изучению, охране и рациональному использованию морских млекопитающих. Архангельск, 9–11 сент. 1986 г. Архангельск: АН СССР – ВНИРО, 1986. С. 220–221.
  20. Shirazi A.S., Qashqaei A.T., S. Faezi S., et al. First confirmed records of white-coat pups of the Endangered Caspian seal Pusa caspica on the coast of Iran // Oryx. 2023. V. 57. Is. 6. P. 784–787.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис 1. Оценка вероятности времени существования последнего общего предка (TMRCA, логарифм числа поколений в прошлом) у трех видов нерп: S – P. sibirica, C – P. caspica, H – P. hispida.

Скачать (62KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2025