In the given paper there are presented the results of analysis for presence in genomes of Vibrio cholerae non-O1/non-O139 strains isolated from ships' ballast water and the coastal zone of Taganrog Gulf class 1 integrons (In1) and SXT/R391 integrative conjugative elements. The intact sequence of In13'-conservative segment (qacEdelta1-sul) was detected in 3 strains (no. 33, 59, 182), whereas in strains V. cholerae no. 28 and 52 there were revealed the probable changes of target sequence (duplication and deletion, respectively). The fragment of SXT/R391 integrase IntSXT gene was detected in 7 of 10 strains tested. Group of strains no. 27, 36, 38, 117 and 59, 182 belong to 2 most common identified genotypes, while the rest isolates are characterized by unique genotypes that indicates to different source of their origins.
В данной работе приведены результаты анализа присутствия в геномах штаммов Vibrio cholerae non-O1/non-O139, выделенных из судовых балластных вод и прибрежной зоны Таганрогского залива, нуклеотидных последовательностей интегронов класса 1 (In1) и интегративных конъюгативных элементов семейства SXT/R391. Интактный фрагмент З’-консервативного сегмента In1 (qacEdeltal-sul) детектирован в 3 штаммах (33, 59, 182), тогда как в штаммах V.cholerae 28 и 52 выявлены вероятные изменения последовательности-мишени (дупликация и делеция соответственно). Фрагмент гена интегразы int SXTSXT/R391 обнаружен в 7 из 10 исследованных штаммов. Группы штаммов № 27, 36, 38, 117 и № 59, 182 принадлежат к двум более часто встречаемым генотипам и идентичны в пределах групп по исследованным генетическим маркерам, тогда как остальные изоляты характеризуются уникальными генотипами, что указывает на их различные источники происхождения.