<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Epidemiology and Infectious Diseases</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Epidemiology and Infectious Diseases</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Эпидемиология и инфекционные болезни</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">3034-2007</issn><issn publication-format="electronic">3034-2015</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Eco-Vector</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">40701</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.17816/EID40701</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">SEROTYPING OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE STRAINS, ISOLATED FROM CHILDREN IN URAL REGION WITH THE USE OF MULTIPLEX PCR</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>СЕРОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ У ДЕТЕЙ НА СРЕДНЕМ УРАЛЕ, МЕТОДОМ МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ПЦР</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Samatova</surname><given-names>E. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Саматова</surname><given-names>Е. В</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>врач-бактериолог лаб. клинической микробиологии ОДКБ №1, заочный аспирант каф. клинической лабораторной диагностики и бактериологии фак. повышения квалификации и профессиональной переподготовки УГМА</p></bio><email>lavrinenko@eka-net.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Druy</surname><given-names>A. E.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Друй</surname><given-names>А. Е</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>очный аспирант каф. клин. лаб. диагностики и бактериологии УГМА, врач клин. лаб. диагностики лаб. молекулярной биологии Центра детской онкологии и гематологии ОДКБ № 1, мл. науч. сотр. лаб. клеточной терапии онкогематологических заболеваний ИМКТ</p></bio><email>Dr-Drui@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Tsaur</surname><given-names>G. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Цаур</surname><given-names>Г. А</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>канд. мед. наук, зав. лаб. молекулярной биологии Центра детской онкологии и гематологии ОДКБ№ , вед. науч. сотр. лаб. клеточной терапии онкогематологических заболеваний ИМКТ</p></bio><email>tsaur@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Boronina</surname><given-names>L. G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Боронина</surname><given-names>Л. Г</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>д-р мед. наук, проф. каф. клин. лаб. диагностики и бактериологии УГМА , зав. лаб. клин. микробиологии ОДКБ №1</p></bio><email>boroninalg@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">State Budgetary Educational Institution of higher professional education Ural State Medical Academy of the Ministry of Health care and Social Development of the Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ГБОУ ВПО Уральская государственная медицинская академия Минздравсоцразвития России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">State Budgetary Institution of Healthcare of the Sverdlovsk region Regional Children's Hospital N1</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ГБУЗ СО Областная детская клиническая больница № 1</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2012-10-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>10</month><year>2012</year></pub-date><volume>17</volume><issue>5</issue><issue-title xml:lang="en">NO5 (2012)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">№5 (2012)</issue-title><fpage>26</fpage><lpage>30</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2020-07-23"><day>23</day><month>07</month><year>2020</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2012, Eco-vector</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2012, ООО "Эко-вектор"</copyright-statement><copyright-year>2012</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Eco-vector</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">ООО "Эко-вектор"</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/></permissions><self-uri xlink:href="https://rjeid.com/1560-9529/article/view/40701">https://rjeid.com/1560-9529/article/view/40701</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>This article presents results of the multiplex PCR investigation of the serotypes distribution of S. pneumoniae strains circulating in Ekaterinburg and the Sverdlovsk region. This study was performed in children with invasive, noninvasive pneumococcal infections and carriers. 118 strains of pneumococci typed out of 129 ones (91.5%) referred to the 15 serotypes: 6A, 6B (20,8%); 23F (13,9%); 19F (11,5%); 8, 9V, 9A, 11F, 11A, 11B, 11C, 11D, 12F, 15A, 33F (11,5%); 3 (10%) 2, 15F, 17F, 22F, 23B (3,9%); 18B, 18C (3.9%), 19A (3,2%); 7F, 19B, 19C, 23A (3,2%); 5,10A (1.6%), 20 (1.6%), 14 (1, 6%); 9L, 9N, 15B, 15C (1,6%); 18F (1,6%); 18A (1.6%). Coincidence rate of serotypes S. pneumoniae, isolated from children with chronic infectious and inflammatory diseases of the lung with serotypes included into the content of the conjugate vaccines is: 7-valent - 69.3%, 10-valent - 98.2%, 11 - and 13-valent - 100%.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В статье приведены результаты исследования серотипового спектра штаммов S. pneumoniae, проведенного с помощью метода мультиплексной ПЦР у детей с инвазивными, неинвазивными инфекциями и носителей, циркулирующих в Екатеринбурге и Свердловской области. Из 129 штаммов пневмококка было типировано 118 (91,5%), которые относились к 15 серотипам: 6A, 6B (20,8%); 23F (13,9%); 19F (11,5%); 8, 9V, 9A, 11F, 11A, 11B, 11C, 11D, 12F, 15A, 33F (11,5%); 3 (10%); 2, 15F, 17F, 22F, 23B (3,9%); 18B, 18C (3,9%); 19А (3,2%); 7F, 19B, 19C, 23A (3,2%); 5, 10А (1,6%); 20 (1,6%); 14 (1,6%); 9L, 9N, 15B, 15C (1,6%); 18F (1,6%); 18А (1,6%). Частота совпадений серотипов S. pneumoniae, выделенных у детей с хроническими инфекционно-воспалительными заболеваниями легких с серотипами, входящими в состав конъюгированных вакцин, составляет: 7-валентной - 69,3%, 10-валентной - 98,2%, 11- и 13-валентными -100%.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>PCR</kwd><kwd>serotypes of S. pneumoniae</kwd><kwd>conjugated vaccines</kwd><kwd>children</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>ПЦР</kwd><kwd>серотипы S. pneumoniae</kwd><kwd>пневмококковые вакцины</kwd><kwd>дети</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Воронина Л.Г., Саматова Е.В., Блинова С.М. и др. Этиологическая значимость микроскопического исследования мокроты у детей с острой и хронической бронхолегочной патологией // Вестн. Урал. мед. акад. науки. - 2011. - Т. 36, № 3. - С. 84-88.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Гольдштейн А.В. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции. Бюл. «Вакцинация» / Бронхолегоч. забол. - 2004. - № 2. - С. 30-35.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Катосова Л.К., Сидорина Т.М., Батуро А.П. и др. Серотипы Streptococcus pneumoniae у детей, больных хроническими воспалительными заболеваниями органов дыхания // Журн. микробиол. - 1990. - №2. - С. 32-37.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Катосова Л.К., Таточенко В.К., Арова А.А. и др. Серотипы Streptococcus pneumoniae у детей, больных острой пневмонией и плевритом // Журн. микробиол.- 1990. - № 5. - С. 23-28.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Козлов Р.С. Пневмококки: прошлое, настоящее и будущее. -Смоленск, 2005.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Козлов Р.С., Чагарян А.Н., Козлова Л.В. и др. Серологическая характеристика и чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей в возрасте до 5 лет в отдельных регионах Российской Федерации // Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. - 2011. - Т. 13, №2. - С. 177-187.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Мартынова А.В. Эпидемиологические аспекты пневмококковых инфекций и молекулярно-генетическая характеристика Streptococcus pneumoniae. Автореф. дис.. д-ра мед. наук. - СПб., 2008.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Маянский А.Н. Патогенетическая микробиология. Руководство. - Н. Новгород, 2006.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Маянский Н.А., Алябьева Н.М., Катосова Л.К. и др. Определение капсульных серотипов пневмококка методом мультиплексной ПЦР // Вопр. диагн. в педиатр. - 2010. - Т. 2, № 6. - С. 6-10.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Миронов О.К., Платонов А.Е., Козлов Р.С. Идентификация и се-ротипирование российских штаммов Streptococcus pneumoniae с применением методик, основанных на ПЦР / Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. - 2011. - Т. 13, № 4. - С. 304-313.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>МР 3.3.1.0027-11 «Эпидемиология и вакцинопрофилактика инфекции, вызываемой Streptococcus pneumoniae». - М., 2011.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях ЛПУ: приказ МЗ СССР №535 от 22.04.85. - М., 1985.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Покровский В.И., Брико Н.И., Ряпис Л.А. Стрептококки и стрептококкозы. - М., 2006.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Рыжов А.А. Вакцины «Pneumo-23» и «Act-HIB» в профилакти ке и лечении хронических заболеваний легких у детей. Дис.. канд. мед. наук. - М., 2004.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Ряпис Л.А., Брико Н.И. Проблема пневмококковых инфекций в России / Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2010. № 1. - С. 4-8.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Таточенко В.К. Клинические проявления пневмококковой инфекции в разных возрастных группах // Бюл. «Вакцинация»/ Пневмокок. инфекц. - 2009. - № 2. - С. 3-7.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Таточенко В.К., Катосова Л.К., Уланова М.А. и др. Периодические и географические различия серотипового спектра пневмококков у детей с респираторными заболеваниями и здоровых носителей // Журн. микробиол. 1994. - № 3. - С. 3-10.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории: методические указания 4.2.2039-05. М., 2005.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Brito D.A., Ramirez M., Lencastre H. Serotyping Streptococcus pneumoniae by Multiplex PCR // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 6. - P. 2378-2384.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Centers for Disease Control and Prevention. Epidemiology and Prevention of Vaccine-Preventable Diseases. 7 th ed. - Atlanta, 2002. - P. 205-217.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Centers for disease control and prevention. PCR Deduction of Pneumococcal Serotypes, October 2009. Serotype distribution of invasive pneumococcal disease isolates among children № 5 years of age, Active Bacterial Core surveillance areas, 2008 vs. 1998-1999. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/pcr.htm.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Centers for disease control and prevention. PCR Deduction of Pneumococcal Serotypes, June 2011. Serotype-specific IPD in children № 5yrs during 2005-2009, Active Bacterial Core surveillance data. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/pcr.htm.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Chang C.C., Singleton R.J., Morris P.S. et al. Pneumococcal vaccines for children and adults with bronchiectasis // Cochrane Database Syst. Rev. - 2009. - Vol. 15, N 2. - CD006316.</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Mackenzie G.A., Leach A.J., Carapetis J.R. et al. Epidemiology of nasopharyngeal carriage of respiratory bacterial pathogens in children and adults: cross-sectional surveys in population with high rates of pneumococcal disease // BMC Infect. Dis. - 2010. - Vol. 10. - P. 304-314.</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Prevention of pneumococcal diseases among infants and young children using a pneumococcal conjugate vaccine. Recommendations of the Advisory Committee on Immunization Practices (ACIP) // Mor-biol. Mortal. Wkly Rep. - 2000. -Vol. 49, RR09. - P. 1-38.</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>Robinson K.A., Baughman W., Rothrock G. et al. Epidemiology of invasive Streptococcus pneumoniae infections in the United States, 1995-1998. Opportunities for prevention in the conjugate vaccine era // J. A. M. A. - 2001. - Vol. 285. - P. 1729-1735.</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>Zangwill K.M., Vadheim C.M., Vannier A.M. et al. Epidemiology of invasive pneumococcal disease in Southern California: implications for design and conduct of a pneumococcal conjugative vaccine trial // J. Infect. Dis. - 1996. - Vol. 174. - P. 752-759.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
