Analysis of antibiotic resistance of bacterial isolates from the lower respiratory tract in patients with community-acquired pneumonia

Full Text

ОБОСНОВАНИЕ

В настоящее время внебольничные пневмонии (ВП) имеют высокую социально-экономическую и эпидемиологическую значимость. В Соединённых Штатах Америки ежегодно регистрируют 5–6 млн случаев ВП, при этом около 1 млн человек нуждаются в госпитализации. В последние годы число госпитализаций по поводу ВП неуклонно растёт, в том числе в отделения интенсивной терапии, особенно среди пожилых людей [1]. Термин «внебольничная пневмония» введён в клиническую практику в конце ХХ века и определяет место возникновения заболевания, а также предполагает ограниченный круг возбудителей, которые в основном колонизируют органы дыхания. ВП представляет собой группу острых инфекционных заболеваний различной этиологии с очаговым поражением респираторных отделов лёгких и обязательным наличием внутриальвеолярной экссудации.

В Российской Федерации официальную регистрацию ВП ввели в формы государственной статистической отчётности в 2011 году. С этого момента заболеваемость ВП растёт. В 2013–2019 годах наблюдали выраженную тенденцию к увеличению показателя заболеваемости со среднегодовым темпом прироста 6,4% [2]. С началом пандемии COVID-19 в 2020 году число зарегистрированных случаев ВП резко выросло. А именно показатель заболеваемости ВП в 2020 и 2021 годах составил 1856,18 и 1148,43 случая на 100 тыс. населения соответственно, при среднемноголетнем показателе равном 391,82 случая на 100 тыс. населения¹. Однако достоверно оценить показатели заболеваемости последних двух лет сложно, поскольку в 2020 году форма федерального статистического наблюдения № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» учитывала ВП совместно с пневмонией, вызванной SARS-CoV-2, а с 2021 года стала учитывать эти два состояния раздельно.

На фоне роста заболеваемости сохраняется высокий уровень смертности от ВП. Так, по данным Т.А. Баяновой и соавт., показатель смертности среди взрослого населения Иркутской области в 2021 году составил 67,7 на 100 тыс. населения, что в 2,5 раза выше уровня 2020 года и в 1,4 раза выше среднего показателя за период с 2011 по 2019 год [3].

Далеко не всегда врачи проводят этиологическую расшифровку ВП в полном объёме. Так, согласно данным формы № 2 государственного статистического наблюдения «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» за 2017 год, в 70,7% случаев этиология ВП осталась не определённой [4]. Причины отсутствия этиологического диагноза различны: от недостаточной оснащённости лабораторий в медицинских организациях до трудностей забора клинического материала из нижних дыхательных путей и его своевременной доставки в лабораторию. Выборочные исследования этиологической структуры ВП в РФ показали, что при культуральном исследовании образцов из нижних дыхательных путей преобладают Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae и Staphylococcus aureus, реже встречаются Mycoplasma pneumoniae и Chlamydophila pneumoniae. Частота выявления отдельных возбудителей зависела от региона, возраста пациентов, сезонности и ряда других факторов [5–8]. Особого внимания заслуживает тот факт, что у более 30–40% обследованных пациентов в образцах мокроты обнаруживали различные виды дрожжеподобных грибов рода Candida [9]. В последнее время появились публикации о причастности малоизученных, но потенциально опасных условно-патогенных бактерий, таких как Рantoea agglomerans, Chryseobacterium indologenes, Elizabethkingia meningoseptica, Raoultella spp. Для этих микроорганизмов характерна способность колонизировать медицинское оборудование, преимущественно в отделениях интенсивной терапии, при этом у них сформировались лекарственно-устойчивые формы [10].

В последние годы наблюдалась тенденция к росту числа антибиотикорезистентных штаммов среди возбудителей ВП, при этом наиболее выраженный рост исследователи отмечали среди грамотрицательных бактерий. Согласно литературным данным, участились случаи резистентности к цефалоспоринам, фторхинолонам, аминогликозидам и карбапенемам [11, 12]. При ВП распространённость коинфекций, вызванных резистентными бактериями и грибами, достигала 24% [13]. Изучение этиологической структуры ВП, а также чувствительности выделенной флоры к антибиотикам, имеет большое практическое значение при назначении эмпирической терапии, особенно в амбулаторных условиях и стационарах, не имеющих собственных бактериологических лабораторий.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Изучить этиологическую структуру и антибиотикорезистентность микроорганизмов, выделенных из нижних дыхательных путей пациентов с внебольничной пневмонией.

МЕТОДЫ

Дизайн исследования

Проведено одноцентровое ретроспективное выборочное неконтролируемое исследование.

Критерии соответствия

Критерии включения:

• возраст пациентов от 18 лет;
• госпитализация в пульмонологическое отделение Городской клинической больницы Казани в период с января 2018 по декабрь 2021 года;
• подтверждённый диагноз «Внебольничная пневмония».

Критерии исключения:

• наличие других диагнозов в анамнезе, кроме ВП;
• госпитализация в пульмонологическое отделение вне указанного временного интервала (до января 2018 или после декабря 2021 года);
• нахождение на искусственной вентиляции лёгких в отделении реанимации.

Условия проведения

Исследование проведено на базе пульмонологического отделения Городской клинической больницы Казани (20 круглосуточных и 10 дневных коек). Ежегодно отделение оказывает помощь более чем 600 пациентам круглосуточного стационара и 200 пациентам дневного стационара.

Продолжительность исследования

В 2024 году проведен ретроспективный анализ 282 медицинских карт (форма № 003/у) пациентов пульмонологического отделения с верифицированным диагнозом «Внебольничная пневмония». Анализируемый период госпитализации охватывал январь 2018 – декабрь 2021 года.

Описание медицинского вмешательства

Диагноз внебольничной пневмонии устанавливали на основании клинической картины, рентгенографии лёгких и лабораторных показателей. Степень тяжести ВП оценивали согласно клиническим рекомендациям «Внебольничная пневмония у взрослых»².

Пациентам с ВП, госпитализированным в пульмонологическое отделение, проводили бактериоскопическое и культуральное исследование респираторного материала (мокроты) в полном соответствии с действующими клиническими рекомендациями «Внебольничная пневмония у взрослых»². Образец свободно отделяемой мокроты получали у всех пациентов с продуктивным кашлем до начала антибактериальной терапии. Этиологически значимым считали выделение штаммов в количестве ≥10⁵ КОЕ/мл, для грибов рода Candida — ≥10⁴ м. кл/мл. Чувствительность к антимикробным препаратам определяли диско-диффузионным методом. Забор трахеального аспирата не проводили, поскольку в исследование не включали пациентов на искусственной вентиляции лёгких.

Основной исход исследования

В качестве основного исхода рассматривали этиологическую структуру микроорганизмов, выделенных из нижних дыхательных путей пациентов с ВП. Структуру устанавливали в соответствии с частотой выделения возбудителей и динамикой их устойчивости к 19 антибактериальным препаратам.

Анализ в группах

Пациентов с диагнозом ВП разделили на подгруппы в зависимости от тяжести клинического течения, выделенного возбудителя, наличия микробных ассоциаций и спектра антибиотикорезистентности.

Методы регистрации исходов

Анализ антибиотикорезистентности проводили путём измерения диаметра зоны подавления роста в соответствии с МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам»³. Определяли чувствительность к 19 антимикробным препаратам: амикацину, амоксиклаву, ампициллину, ко-тримоксазолу, ванкомицину, гентамицину, имипенему, левофлоксацину, линкомицину, оксациллину, пенициллину, тетрациклину, хлорамфениколу, цефепиму, цефотаксиму, цефтазидиму, цефтриаксону, ципрофлоксацину, эритромицину. Чувствительность штаммов C. albicans к фунгицидным средствам не исследовали.

Этическая экспертиза

Протокол исследования был рассмотрен Локальным этическим комитетом Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Казанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения РФ, выписка из протокола заседания № 3 от 18 марта 2025 года.

Статистический анализ

Запланированный размер выборки

Размер выборки предварительно не рассчитывали.

Статистические методы

Для анализа результатов использовали программы Microsoft Excel 2016 (Microsoft, США) и WinPepi version 11,65 (J.H. Abramson, США). Частоту встречаемости признака представили в виде доли и её стандартной ошибки (p±se, %). Нормальность распределения данных определяли с помощью тестов Шапиро–Уилка и Шапиро–Франсиа. Для сравнения долей использовали параметрический показатель t. Связь между исследуемыми признаками исследовали с помощью коэффициента корреляции Пирсона. Значимость коэффициента корреляции Пирсона определяли по таблице критических значений t-критерия Стьюдента при числе степеней свободы, равном числу пар наблюдений минус два.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Объекты исследования

Проанализировали 282 медицинские карты стационарных пациентов (форма № 003/у) пульмонологического отделения Городской клинической больницы г. Казани с документально подтверждённым диагнозом «Внебольничная пневмония», госпитализированных с января 2018 по декабрь 2021 года. Возраст пациентов составил от 18 до 94 лет. В выборку вошли 139 мужчин и 143 женщины. Средний возраст пациентов составил 60,30±1,1 года: мужчин — 59,13±1,5 года, женщин — 61,43±1,6 года. Данные имели нормальное распределение: тест Шапиро–Уилка (W=0,8660, p=0,170), тест Шапиро–Франсиа (W=0,8752, p=0,176).

Основные результаты исследования

За период с января 2018 по декабрь 2021 года в пульмонологическом отделении стационарное лечение прошли 282 пациента с ВП. Этиологию заболевания установили у 245 пациентов (86,88±2,01%). У этих исследуемых было выделено 290 клинических изолятов микроорганизмов. Основными этиологическими патогенами в мокроте были: C. albicans как в монокультуре, так и в ассоциациях с бактериальной флорой (47,9±4,4%); S. pyogenes (20,2±5,4%); S. pneumoniae (14,2±5,6%). Частота выделения C. albicans достоверно превышала частоту встречаемости других микроорганизмов (p < 0,001). Клинические изоляты S. pyogenes выделяли достоверно чаще по сравнению с изолятами Enterobacter agglomerans, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Citrobacter diversus (p < 0,05). Доля ассоциаций бактериальных возбудителей и сочетанных форм с грибом C. albicans в этиологической структуре пневмонии составляла 15,51±2,1%. Наиболее частой комбинацией оказалась ассоциация S. pyogenes и C. albicans (4,14±1,2%). Далее следуют сочетания S. pyogenes со S. aureus, а также S. aureus с C. albicans (оба варианта по 1,38±0,7%).

При моноэтиологичных ВП оценивали взаимосвязь тяжести заболевания и вида выделенного из мокроты микроорганизма. При выделении S. aureus частота регистрации среднетяжёлой (59,26±9,46%) и тяжёлой (40,74±9,46%) форм заболевания существенно не отличалась (табл. 1). При пневмониях, вызванных E. agglomerans, S. pyogenes, S. pneumoniae, регистрировалась преимущественно среднетяжёлая форма заболевания: в 80,0±12,6%, 73,68±5,8% и 65,0±7,5% случаев соответственно (p < 0,01). Не выявили различий в частоте тяжёлых форм пневмонии в зависимости от устойчивости возбудителей к антимикробным препаратам.

 

Таблица 1. Распределение пациентов по степени тяжести пневмонии в зависимости от этиологии заболевания

Виды микроорганизмов	Резистентные штаммы		Чувствительные штаммы		Итого
	Пневмония средней степени тяжести	Тяжёлая пневмония	Пневмония средней степени тяжести	Тяжёлая пневмония
C. diversus	1	0	0	0	1
E. agglomerans	8	2	0	0	10
E. coli	2	1	0	0	3
K. pneumoniae	5	0	0	0	5
K. pneumoniae subsp. ozaenae	3	1	0	0	4
S. aureus	13	11	3	0	27
S. pyogenes	20	5	22	10	57
S. pneumoniae	24	9	2	5	40
Итого	76	29	27	15	147

 

Исследование частоты антибиотикорезистентности показало, что 71,43±3,7% выделенных клинических изолятов обладали устойчивостью к одному или нескольким антибактериальным препаратам. Антибактериальной устойчивостью обладали менее половины исследованных культур S. pyogenes (43,86±6,6%) и более 80% изолятов S. pneumoniae и S. aureus. Абсолютно все бактерии родов Citrobacter, Enterobacter, Escherichia и Klebsiella проявляли устойчивость как минимум к одному антимикробному агенту (табл. 2).

 

Таблица 2. Характеристика резистентности к антимикробным препаратам микроорганизмов, выделенных из мокроты пациентов с внебольничной пневмонией

Виды бактерий	Антибиотикорезистентные штаммы,		Антимикробные препараты, к которым выявлена резистентность,
	n	%±se	%±se
C. diversus	1	100±0	11
E. agglomerans	10	100±0	42,11±15,613
E. coli	3	100±0	38,89±28,146
K. pneumoniae	5	100±0	36,36±21,513
K. pneumoniae subsp. ozaenae	4	100±0	32,14±23,351
S. aureus	24	88,89±6,048	19,58±8,099
S. pyogenes	25	43,86±6,573	5,88±4,706
S. pneumoniae	33	82,5±6,008	26,21±7,656
Итого	105	71,43±3,726	18,01±3,75

Примечание. ¹ стандартную ошибку не рассчитывали, поскольку был выделен один штамм.

 

Анализ динамики уровня устойчивости клинических штаммов, выделенных у пациентов с ВП, показал относительную стабильность показателя в период 2018–2021 год. Доля резистентных штаммов варьировала незначительно: от 62,5±8,6% в 2020 году до 77,14±5,02% в 2018 году (рис. 1). При изучении ежегодной динамики обнаружили сильную положительную корреляцию между частотой появления антибиотикорезистентных штаммов S. aureus и S. pyogenes (r=0,98±0,011, p < 0,01). Корреляция между другими изолятами отсутствовала.

 

Рис. 1. Динамика доли антибиотикорезистентных штаммов в структуре клинических изолятов, выделенных от пациентов с внебольничной пневмонией.

 

Все выделенные изоляты C. diversus, E. agglomerans, E. coli, K. pneumoniae и K. pneumoniae subsp. ozaenae демонстрировали устойчивость к одному или нескольким антимикробным средствам. У S. aureus и стрептококков (S. pyogenes, S. pneumoniae) уровень антибиотикорезистентности оказался выше в 2019 и 2021 году по сравнению с 2018 и 2020 годом (рис. 2).

 

Рис. 2. Динамика антибиотикорезистентности штаммов, выделенных от пациентов с внебольничной пневмонией.

 

Исследование спектра устойчивости выделенных микроорганизмов из нижних дыхательных путей представлено в Приложении 1. Все рассмотренные клинические изоляты S. pyogenes демонстрировали высокую чувствительность к пенициллинам, включая защищённые препараты (амоксиклав). S. aureus проявлял высокую устойчивость к обычному пенициллину (88,9±6,1%), а также частичную резистентность к эритромицину (26,9±8,5%). При этом сохранялась высокая чувствительность к амоксиклаву, оксациллину, ванкомицину и цефтриаксону. Изоляты S. pneumoniae показывали множественную лекарственную устойчивость к стандартным антибактериальным средствам, таким как незащищённые пенициллины, ко-тримоксазол и амоксиклав. Тем не менее, бактерии проявляли чувствительность к современным группам антибиотиков: цефалоспоринам, карбапенемам, фторхинолонам и макролидам.

Выделенные грамотрицательные патогены обладали полирезистентностью к трём и более препаратам. Например, изоляты E. coli в 100% случаев были устойчивы к ампициллину и демонстрировали заметную устойчивость к ципрофлоксацину и гентамицину (66,6±27,2%). K. pneumoniae проявляла абсолютную устойчивость к ампициллину (100%) и высокий уровень резистентности к амоксиклаву (80,0±17,9%). Устойчивость к другим препаратам оказалась ниже: к ципрофлоксацину — 40,0±21,9%, к гентамицину — 20,0±17,9%. Подобную картину наблюдали и у изолятов E. agglomerans: абсолютная резистентность к ампициллину (100%), высокие показатели устойчивости к амоксиклаву (88,9±9,9%) и цефтриаксону (80,0±12,6%). Степень устойчивости к ципрофлоксацину составила 20,0±12,6%, а к аминогликозидам — 30,0±14,5%.

ОБСУЖДЕНИЕ

Исследование включало анализ антибиотикорезистентности штаммов бактерий, выделенных у пациентов с ВП в период, предшествовавший пандемии новой коронавирусной инфекции, и в течение двух лет после начала пандемии COVID-19.

Обсуждение основного результата исследования

Пациенты с ВП, поступившие на стационарное лечение, как правило, получали первичный курс антибиотиков ещё на амбулаторном этапе лечения. Вероятно, поэтому в нашем исследовании в 47,9±4,4% случаев положительных посевов пришлись на C. albicans как в монокультуре, так и в ассоциациях с бактериальной флорой. Полученные данные согласуются с результатами отечественных и зарубежных исследований [9–11].

В период пандемии COVID-19 доля грибов C. albicans возросла в 1,36 раза в 2020 году и в 1,84 раза в 2021 году по сравнению с 2019 годом. На протяжении всего анализируемого периода нарастала частота обнаружения ассоциаций бактериальных возбудителей с дрожжевой микрофлорой. До начала пандемии в этиологии ВП преобладали бактериальные микст-инфекции, вызванные грамположительными кокками, и ассоциации грибов C. albicans с грамположительной флорой. Начиная с 2020 года обнаружили рост числа зарегистрированных случаев, обусловленных ассоциациями грамотрицательных возбудителей, таких как E. agglomerans и K. pneumoniae, с грибами. Столь частое обнаружение дрожжевых клеток в мокроте (или ротовой полости) на фоне пандемии могло быть обусловлено как снижением иммунного статуса пациентов, так и применением кортикостероидов и антибиотиков широкого спектра действия. В этих условиях кандидоносительство создаёт предпосылки для дальнейшего размножения кандид и перехода от носительства к системному поражению дыхательных путей [9].

Этиологическая структура ВП была представлена разнообразной грамположительной и грамотрицательной флорой. За анализируемый период доля грамположительных бактерий достоверно снизилась с 92,86±11,5% в 2018 году до 61,54±21,8% в 2021 году. Одновременно доля грамотрицательной флоры выросла с 7,14±11,5% до 38,46±21,8%, главным образом за счёт E. agglomerans и K. pneumoniae. После появления SARS-CoV-2 в 2020 году многие страны, включая РФ, также наблюдали сдвиг в сторону грамотрицательных палочек, включая неферментирующие бактерии [6, 9, 14–17]. Следует отметить, что в нашем исследовании неферментирующие грамотрицательные бактерии не встречались.

Важным этапом работы стало определение чувствительности выделенных возбудителей к антимикробным препаратам. Анализ показал, что грамотрицательные бактерии К. pneumoniae, E. agglomerans демонстрировали высокий уровень резистентности к ампициллину (100±0%), амоксиклаву (80±17,9% и 88,9±9,94% соответственно), цефтриаксону (50±22,4% и 80±12,6% соответственно), ципрофлоксацину (40±21,9% и 20±12,6% соответственно) и амикацину (20±17,9% и 30±14,5% соответственно). При этом они сохраняли чувствительность к цефалоспоринам IV поколения и карбапенемам. Аналогичные результаты получены и в других регионах РФ [9, 14, 18]. В то же время исследование, проведённое в Томске, показало диаметрально противоположные данные: резистентность К. pneumoniae к цефалоспоринам III–IV поколения превысила 78% изолятов, а к карбапенемам составила от 40 до 54% [19].

Выделенные из мокроты пациентов с внебольничной пневмонией изоляты E. coli продемонстрировали высокую восприимчивость к цефалоспоринам III–IV поколения. Однако наблюдали высокий уровень устойчивости ко многим другим антибиотикам: 100% изолятов оказались устойчивы к ампициллину, а 66,67±27,2% — к гентамицину и ципрофлоксацину. Крайне низкую чувствительность данного возбудителя к фторхинолонам (не более 16%) в аналогичный период выявили в исследовании О.М. Ромашова и соавт. [20].

Грамположительная флора проявляла высокую устойчивость к антибиотикам пенициллинового ряда. Так, у S. pneumoniae наблюдали высокую резистентность к пенициллину (75,0±6,8%), оксациллину (73,5±6,9%), ампициллину (71,0±7,2%), ко-тримоксазолу (34,3±7,5%) и амоксиклаву (33,3±7,5%). В научной литературе встречаются противоречивые данные о динамике антибиотикорезистентности пневмококка. Ряд авторов указывают на рост устойчивых штаммов к бета-лактамным антибиотикам [18, 19], другие исследователи отмечают сохранение чувствительности к данной группе [21–23]. Другой представитель стрептококков, S. pyogenes, характеризовался низким уровнем антибиотикорезистентности. Устойчивость отмечали преимущественно к эритромицину, которая составила 28,1±5,9%.

Анализ чувствительности штаммов S. aureus показал следующее распределение устойчивости: все изоляты были чувствительны к амоксиклаву, оксациллину, цефтриаксону, ванкомицину. Однако важно отметить значительную долю устойчивых изолятов к пенициллину (88,9±6,1%) и эритромицину (26,9±8,5%). Эти данные подчёркивают необходимость взвешенного подхода к назначению макролидов и обычных пенициллинов при лечении стафилококковых инфекций, особенно с учётом риска распространения полирезистентных штаммов.

Ограничения исследования

При планировании и проведении исследования размер выборки для достижения требуемой статистической мощности не рассчитывали. Именно поэтому полученная выборка участников не может считаться в достаточной степени репрезентативной, что не позволяет экстраполировать результаты и их интерпретацию на генеральную совокупность аналогичных пациентов за пределами исследования.

Определение антибиотикорезистентности клинических изолятов бактерий проводили рутинным диско-диффузионным методом, который не позволяет определить минимальную ингибирующую и минимальную бактерицидную концентрацию антибиотика. Зоны ингибирования роста микроорганизмов вокруг дисков с антибиотиками зависят от многих факторов: рецептуры питательной среды, толщины слоя агара, плотности прилегания диска с антибиотиком к поверхности агара, влажности, pH среды, количества антибиотика в диске, посевной дозы и температуры культивирования. Соблюдение всех этих и других условий, влияющих на результаты определения антибиотикорезистентности, а также использование тест-микроорганизмов в качестве контроля выступает важным условием получения репрезентативных результатов. Лаборатория, проводившая исследования антибиотикорезистентности, имеет сертификат на работу с микроорганизмами 3–4 групп патогенности.

Данное исследование проведено по материалам медицинской документации пациентов, проходивших лечение в пульмонологическом отделении Городской клинической больницы Казани. В связи с началом пандемии COVID-19 в 2020 году отделение перепрофилировали для лечения пациентов с новой коронавирусной инфекцией, что значительно повлияло на когорту госпитализированных пациентов: в 2020–2021 годах доля таких пациентов составляла 13,68±2,9%. Аналогичные условия сложились и в других стационарах.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Авторы, изучавшие антибиотикорезистентность микроорганизмов, выделенных от пациентов с ВП в период до и после начала пандемии COVID-19, получили неоднородные, иногда противоречивые результаты. Данные, полученные в представленном исследовании, отражают региональную специфику и актуальны для территории, на которой проводили работу. Настоящее исследование представляет собой попытку получить новые данные о проблеме устойчивости к антибиотикам микроорганизмов, выделенных от пациентов с ВП в Казани в период с 2018 по 2021 год.

Согласно результатам нашего исследования, в этиологической структуре ВП доминировали грибы C. albicans, а также бактерии S. pyogenes, S. pneumoniae. Начало пандемии COVID-19 сопровождалось сменой этиологической структуры ВП. Начиная с 2020 года отметили увеличение грамотрицательной микрофлоры как в случаях моноинфекции, так и в ассоциации с грибковой флорой.

Более двух третей штаммов, выделенных из мокроты пациентов с ВП, обладали устойчивостью к одному или нескольким антибиотикам. Среди всех исследованных бактерий наибольшую лекарственную устойчивость продемонстрировала грамотрицательная микрофлора (К. pneumoniae, E. agglomerans, E. coli).

Среди грамположительных бактерий полирезистентными оказались изоляты S. pneumoniae, однако они сохранили чувствительность к макролидам и цефалоспоринам III–IV поколения. Важно отметить, что ни один из выделенных изолятов S. aureus не проявил устойчивость к антибиотикам группы бета-лактамов. Также выявили, что практически все изоляты S. pyogenes имели хорошую чувствительность к большинству тестируемых антибиотиков, за исключением макролидов: примерно четверть (28,1±5,9%) изолятов показала к ним устойчивость.

Наличие антибиотикорезистентности у возбудителей не влияло на тяжесть течения пневмонии. Результаты данного исследования актуальны для региона, в котором проводили исследование. Их можно использовать при назначении этиотропной терапии пациентам с ВП, а также в рамках микробиологического мониторинга антибиотикорезистентности и эпидемиологического надзора за внебольничной пневмонией в постпандемический период.

ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Вклад авторов. Н.М. Хакимов — определение концепции, статистическая обработка данных, пересмотр и редактирование рукописи; А.И. Локоткова — определение концепции, визуализация данных, пересмотр и редактирование рукописи; Л.Ф. Латыпова — сбор данных, написание черновика рукописи. Все авторы одобрили рукопись (версию для публикации), а также согласились нести ответственность за все аспекты настоящей работы, гарантируют надлежащее рассмотрение и решение вопросов, связанных с точностью и добросовестностью любой её части.

Этическая экспертиза. Исследование одобрено локальным этическим комитетом ФГБОУ ВО «Казанский ГМУ» Минздрава России, выписка из протокола заседания № 3 от 18 марта 2025 года. Все участники исследования подписали форму информированного добровольно согласия до включения в исследование.

Источники финансирования. Отсутствуют.

Раскрытие интересов. Авторы сообщают об отсутствии отношений, деятельности и интересов за последние три года (36 месяцев), связанных с третьими лицами, интересы которых могут быть затронуты содержанием статьи. В числе авторов нет лиц, признанных иностранными агентами.

Заявление об оригинальности. При создании настоящей работы авторы не использовали ранее опубликованные сведения (текст, иллюстрации, в том числе и из своих работ).

Доступ к данным. Авторы сообщают, что все данные представлены в статье и приложении к ней.

Генеративный искусственный интеллект. При создании настоящей статьи технологии генеративного искусственного интеллекта не использовали.

Рассмотрение и рецензирование. Настоящая работа подана в журнал в инициативном порядке и рассмотрена по обычной процедуре. В рецензировании участвовали внешний рецензент и член редакционной коллегии журнала.

ADDITIONAL INFORMATION

Author contributions: N.M. Khakimov: conceptualization, formal analysis, writing—review & editing; A.I. Lokotkova: conceptualization, visualization, writing—review & editing; L.F. Latypova: data curation, writing—original draft. All the authors approved the version of the manuscript to be published and agreed to be accountable for all aspects of the work, ensuring that questions related to the accuracy or integrity of any part of the work are appropriately investigated and resolved.

Ethics approval: The study was approved by the Local Ethics Committee of Kazan State Medical University (Extract from Meeting Minutes No. 3, dated March 18, 2025). All participants provided written informed consent form before being included in the study.

Funding sources: No funding.

Disclosure of interests: The authors have no relationships, activities, or interests for the last three years related to for-profit or not-for-profit third parties whose interests may be affected by the content of the article. None of the authors is recognized as a foreign agent.

Statement of originality: No previously obtained or published material (text, images, including the authors’ own prior works) was used in this study or article.

Data availability statement: All data obtained in this work are available in the article and its supplementary material.

Generative AI: No generative artificial intelligence technologies were used to prepare this article.

Provenance and peer-review: This article was submitted unsolicited and reviewed following the standard procedure. The peer-review process involved an external reviewer and a member of the Editorial Board.

 

Приложения

Приложение 1. Антибиотикорезистентность бактерий, выделенных из мокроты пациентов с внебольничной пневмонией

Вид микроорганизма

Доля резистентных штаммов, (M±m, %)

Амикацин

Амоксиклав

Ампициллин

Ко-тримоксазол

Ванкомицин

Гентамицин

Имипенем

Левофлоксацин

Линкомицин

Оксациллин

Пенициллин

Тетрациклин

Хлорамфеникол

Цефепим

Цефотаксим

Цефтазидим

Цефтриаксон

Ципрофлоксацин

Эритромицин

C. diversus

0±0

0±0

100±0

н/и

н/и

0±0

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

0±0

н/и

н/и

0±0

н/и

E. agglomerans

30,00± 14,49

88,90± 9,94

100±0

н/и

н/и

30,00± 14,49

0±0

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

0±0

0±0

80,00± 12,65

20,00± 12,65

н/и

E. coli

0±0

0±0

100±0

н/и

н/и

66,70± 27,22

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

0±0

н/и

н/и

66,70± 27,22

н/и

K. pneumoniae

20,00± 17,89

80,00± 17,89

100±0

н/и

н/и

20,00± 17,89

20,00± 17,89

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

0±0

0±0

50,00± 22,36

40,00± 21,91

н/и

K. pneumoniae subsp. ozaenae

25,00± 21,65

50±25

100±0

н/и

н/и

50±25

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

0±0

0±0

н/и

0±0

н/и

S. aureus

0±0

0±0

н/и

н/и

0±0

14,80± 6,84

0±0

н/и

н/и

0±0

88,90± 6,05

н/и

н/и

н/и

н/и

н/и

0±0

7,40± 5,04

26,90± 8,54

S. pyogenes

н/и

0±0

0±0

н/и

н/и

н/и

н/и

15,80± 4,83

16,10± 4,86

0±0

0±0

0±0

3,90± 2,57

0±0

0±0

0±0

н/и

0±0

28,10± 5,95

S. pneumoniae

н/и

33,30± 7,45

71,00± 7,18

34,30± 7,51

н/и

н/и

0±0

7,50± 4,16

12,50± 5,23

73,5± 6,98

75,00± 6,85

21,60± 6,51

22,20± 6,57

0±0

0±0

0±0

н/и

н/и

13,20± 5,34

Итого

20,80± 2,38

18,00± 2,26

40,90± 2,89

34,30± 2,79

0±0

24,00± 2,51

4,00± 1,15

12,40± 1,93

14,60± 2,07

24,3± 2,52

43,30± 2,91

20,50± 2,37

6,70± 1,46

0±0

0±0

0±0

60,00± 2,88

15,40± 2,12

23,1± 2,0

Примечание. н/и — исследование не выполняли.

 

¹ On the state of sanitary and epidemiological welfare of the population in the Russian Federation in 2021: State Report. Moscow: Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing; 2022. 340 p. [cited 2025 Nov 5] (In Russ.) ISBN: 978–5–7508–1910–2. Available from: https://www.rospotrebnadzor.ru/upload/iblock/594/sqywwl4tg5arqff6xvl5dss0l7vvuank/Gosudarstvennyy-doklad.-O-sostoyanii-sanitarno_epidemiologicheskogo-blagopoluchiya-naseleniya-v-Rossiyskoy-Federatsii-v-2021-godu.pdf

² Russian Respiratory Society, Interregional Association for Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. Clinical guidelines: Community-acquired pneumonia in adults. ICD-10 codes: J13-J18. Moscow: Ministry of Health of the Russian Federation; 2019. [cited 2025 May 16] (In Russ.) Available from: https://medaccreditation.online/klinicheskiye_rekomendatsii/vnebol-nichnaya-pnevmoniya-u-vzroslyh_654_2

³ Ministries of Health of Russia. Determination of the sensitivity of microorganisms to antibacterial drugs: Methodological guidelines. Moscow: Federal Center for State Sanitary and Epidemiological Surveillance; 2004. 91 p. [cited 2025 Fev 14] (In Russ.) Available from: https://meganorm.ru/Data2/1/4293754/4293754463.pdf

About the authors

Niyaz M. Khakimov

Kazan State Medical University

Email: hakimniaz@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-7895-0012
SPIN-code: 4881-5607

MD, Cand. Sci. (Medicine), Associate Professor

Russian Federation, Kazan

Alla I. Lokotkova

Kazan State Medical University

Author for correspondence.
Email: allalok12@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4482-6050
SPIN-code: 5262-1969

MD, Cand. Sci. (Medicine), Associate Professor

Russian Federation, Kazan

Lyasan F. Latypova

City Clinical Hospital No. 12, Kazan

Email: lyasan1979@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-2986-3769
SPIN-code: 4540-0181
Russian Federation, Kazan

References

Supplementary files