Отправить статью по E-mail 
R- и S-пируватсодержащий полисахарид клеточной стенки Rathayibacter sp. ВКМ Ac-2927
- Авторы: Кокоулин М.C.1, Потехина Н.В.2, Тульская E.M.2, Оспенников Ю.В.3, Евтушенко Л.И.4
-
Учреждения:
- Тихоокеанский институт биоорганической химии имени Г.Б. Елякова ДВО РАН
- Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
- Институт биохимии и физиологии микроорганизмов имени Г. К. Скрябина РАН
- ФИЦ Пущинский научный центр биологических исследований РАН, Всероссийская коллекция микроорганизмов (ВКМ)
- Выпуск: Том 90, № 4 (2025)
- Страницы: 550-558
- Раздел: Статьи
- URL: https://rjeid.com/0320-9725/article/view/685804
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0320972525040049
- EDN: https://elibrary.ru/IHUOJN
- ID: 685804
Цитировать
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Аннотация
Химическими методами и методом спектроскопии ЯМР установлены структуры двух гликополимеров клеточной стенки штамма Rathayibacter sp. ВКМ Ac-2927 (семейство Microbacteriaceae, класс Actinomycetes), изолированного из листьев липы, поражённых листовым минёром. Первый полимер, рамноманнан с гетерогенной цепью, построен из регулярно чередующихся остатков α-D-рамнозы и α-D-маннозы, связанных (1→3)- и (1→2)-гликозидными связями, и содержит в минорном количестве боковые остатки β-D-ксилопиранозы (структура представлена в тексте). Второй полимер, ацеталированный R- и S-пировиноградной кислотой, состоит из разветвлённых тетрасахаридных звеньев: →3)-α-D-Galp4,6-(R-Pyr)-(1→3)-β-D-Glcp-(1→6)-[β-D-Galp3,4-(S-Pyr)-(1→4)]-α-D-Manp-(1→. Структура данного полисахарида является новой для представителей Rathayibacter и прокариот в целом. Результаты настоящего исследования свидетельствуют о структурном разнообразии микробных гликополимеров и согласуются с ранее полученными данными о специфичности их состава для видов рода Rathayibacter.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
М. C. Кокоулин
Тихоокеанский институт биоорганической химии имени Г.Б. Елякова ДВО РАН
Email: potekhina56@mail.ru
Россия, Владивосток
Н. В. Потехина
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Email: potekhina56@mail.ru
Россия, Москва
E. M. Тульская
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Email: potekhina56@mail.ru
Россия, Москва
Ю. В. Оспенников
Институт биохимии и физиологии микроорганизмов имени Г. К. Скрябина РАН
Email: potekhina56@mail.ru
Россия, Пущино
Л. И. Евтушенко
ФИЦ Пущинский научный центр биологических исследований РАН, Всероссийская коллекция микроорганизмов (ВКМ)
Автор, ответственный за переписку.
Email: potekhina56@mail.ru
Россия, Пущино, Московская обл.
Список литературы
- Evtushenko, L. I., and Dorofeeva, L. V. (2012) Genus XXII. Rathayibacter Zgurskaya, Evtushenko, Akimov and Kalakoutskii 1993, 147VP in Bergey’s manual of systematic bacteriology (Goodfellow, M., Kämpfer, P., Busse, H-J., Trujillo, M. E., Suzuki, K.-I., Ludwig, W., Whitman, W. B., eds) 2nd Edn, vol. 5. Springer, New York, Dordrecht, Heidelberg, London, pp. 953-964.
- Potekhina, N. V., Tul’skaya, E. M., Ospennikov, Y. V., and Evtushenko, L. I. (2023) Cell wall glycopolymers as chemotaxonomic characteristics of the genus and species Rathayibacter, Microbiology, 92, S2-S6, https://doi.org/10.1134/S0026261723603822.
- Shashkov, A. S., Potekhina, N. V., Tul’skaya, E. M, Dmitrenok, A. S., Senchenkova, S. N., Torgov, V. I., Dorofeeva, L. V., and Evtushenko, L. I. (2024) New lactate- and pyruvate-containing polysaccharide and rhamnomannan with xylose residues from the cell wall of Rathayibacter oskolensis VKM Ac-2121T, Carbohydr. Res., 540, 109145, https://doi.org/10.1016/j.carres.2024.109145.
- Шашков А. С., Потехина Н. В, Тульская Е. М., Дмитренок А. С., Сенченкова С. Н., Дорофеева Л. В., Евтушенко Л. И. (2024) Новые рамнозосодержащие гликополимеры клеточной стенки Rathayibacter festucae ВКМ Ac-1390T, Биохимия, 89, 2081-2091, https://doi.org/10.31857/S0320972524120051.
- Tarlachkov, S. V., Ospennikov, Y. V., Demidov, A. V., Starodumova, I. P., Dorofeeva, L. V., Prisyazhnaya, N. V., et al. (2022) Draft genome sequences of 9 actinobacteria from the family Microbacteriaceae associated with insect- and nematode-damaged plants, Microbiol. Res. Announc., 11, e00487-22, https://doi.org/10.1128/mra.00487-22.
- Potekhina, N. V., Streshinskaya, G. M., Tul’skaya, E. M., and Shashkov, A. S. (2011) In Methods in Microbiology (Rainey, F. A., and Oren, A., eds), Vol. 38, Academic Press/Elsevier, Amsterdam, pp. 131-164, https://doi.org/10.1016/B978-0-12-387730-7.00020-6.
- Dmitrenok, A. S., Streshinskaya, G. M., Tul’skaya, E. M., Potekhina, N. V., Senchenkova, S. N., Shashkov, A. S., Bilan, M. I., Starodumova, I. P., Bueva, O. V., and Evtushenko, L. I. (2017) Pyruvylated cell wall glycopolymers of Promicromonospora citrea VKM Ac-665T and Promicromonospora sp. VKM Ac-1028, Carbohydr. Res., 449, 34-142, https://doi.org/10.1016/j.carres.2017.07.008.
- Leontein, K., Lindberg, B., and Lonngren, J. (1978) Assignment of absolute configuration of sugars by g.l.c. of their acetylated glycosides formed from chiral alcohols, Carbohydr. Res., 62, 359-362, https://doi.org/10.1016/S0008-6215(00)80882-4.
- Shashkov, A. S., Lipkind, G. M., Knirel, Y. A., and Kochetkov, N. K. (1988) Stereometrical factors determining the effects of glycosylation on the 13C chemical shifts in carbohydrates, Magn. Reson. Chem., 26, 735-747, https://doi.org/10.1002/mrc.1260260904.
- Garegg, P.J., Jansson, P.-E., Lindberg, B., Lindh, F., and Lönngren, J. (1980) Configuration of the acetal carbon atom of pyruvic acid acetals in some bacterial polysaccharides, Carbohydr. Res., 79, 127-132, https://doi.org/10.1016/S0008-6215(00)83666-6.
- Chun, J., Oren, A., Ventosa, A., Christensen, H., Arahal, D. R., da Costa M. S., Rooney, A. P., Yi, H., Xu, X. W., De Meyer, S., and Trujillo, M. E. (2018) Proposed minimal standards for the use of genome data for the taxonomy of prokaryotes, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 68, 461-466, https://doi.org/10.1099/ijsem.0.002516.
Дополнительные файлы
